《越狱》是由温特沃斯·米勒、多米尼克·珀塞尔等人主演的犯罪类电视剧，于2005年9月1日在美国首播。该电视剧共五季，第一季、第二季由布莱特·拉特纳执导，第三季由文森特·马西阿诺执导，第四季由凯文·霍克斯执导，第五季由尼尔森·麦科米克执导。该剧在第四季为最终结局，第五季为9集的迷你剧，讲述的是原剧剧终后几年的故事，2019年《越狱特别篇：最后一越》上映，该篇将讲述众人在《越狱》正剧最后的大结局忽略掉的四年之间发生的事。
该系列电视剧讲述了迈克尔·斯科菲尔德（温特沃斯•米勒饰）和哥哥林肯（多米尼克•珀塞尔饰）两兄弟相依为命。亚伯拉罕·林肯含冤入狱，而后迈克尔通过一年时间的精心准备后将被判了死刑的林肯顺利救走。FBI探员亚历山大追捕越狱的所有人，追捕过程中真相慢慢被揭露，前三季里的正反派合作，联合起来搞垮了幕后集团“公司”，搞垮了幕后黑手“将军”，揭露了所有背后的阴谋，全员获得了自由。第五季，主要是CIA（中情局）反叛分子“波塞冬”设陷阱，使得主角为其所用。虽然一波三折，但最后主角终究是失败了。
《越狱》首播于2005年9月1日，至2017年4月4日最后一季播出大结局，共播出五季90集。《越狱》第一季在美国播出时，创下了福克斯电视台7年来最高的周一收视纪录，最多时有1800万观众收看该剧，美国主流媒体纷纷用“革命性的突破”来形容此剧，然而从第二季开始，该剧的口碑逐渐下降，在美国的收视数据也不断下滑，《越狱》第二季平均收视人数1010万，到第四季第17集时则仅剩338万。此外，《越狱》的成功使得观看美剧的风潮开始在中国盛行，曾经处于地下的字幕组由此进入主流视野，通过网络下载观看美剧也由此成为内地观众的一种新的电视剧消费习惯。
剧情简介
《越狱第一季》
迈克尔·史考菲（温特沃斯·米勒饰）正陷于无望的困境中——他的哥哥林肯·伯劳斯（多米尼克·珀塞尔饰）被认定犯有谋杀罪被投入了福克斯河监狱的死囚牢。虽然所有的证据都指出林肯就是凶手，迈克尔坚信兄长是无辜的。林肯的死刑执行日越来越逼近，在没有其他选择的情况下，迈克尔持枪闯入了一家银行，被捕入狱后来到了林肯的身边。身为建筑工程师的迈克尔参与了监狱的改造工程而对这里了若指掌，他设计了完整的越狱计划，入狱的唯一目的就是要把林肯救出生天并还其清白。
林肯的昔日女友维罗妮卡·多诺万（罗宾·汤尼饰）是谋杀案的辩方律师，她相信林肯是被陷害的。在继续调查的过程中，维罗妮卡发现这远不是一桩单纯的谋杀案，被害人之死牵扯了许多大人物的利益——副总统的身影渐渐从幕后显现。而随着调查的深入，危险也在迫近维罗妮卡，证人相继神秘被杀，林肯的家人也遭遇不幸，而追杀维罗妮卡的神秘人物，竟然是联邦调查局的秘密探员。
与此同时，迈克尔在狱中艰难地准备着越狱计划，意想不到的人和事接连出现在通向自由的道路上。
《越狱第二季》
第一季结尾，迈克尔与哥哥林肯及其他狱友成功越狱，但逃脱的囚犯们很快发现，他们的逃亡之路远未结束。FBI追捕逃犯的资深探员亚历山大·马洪（由威廉·菲克纳饰演）在副总统的授权下成为捉捕小组的主管，决心将他们逐个捉拿归案。
迈克尔和亚伯拉罕·林肯不仅面临FBI的追捕，还开始调查林肯被陷害的真相，希望能揭开背后的政府阴谋。他们发现，林肯的案件与一宗庞大的政府阴谋有关，这涉及到政治、金钱和权力的交换。同时，其他逃犯也各自面临不同的困境和挑战。费尔南多·苏克雷（阿莫里·诺拉斯科饰）在逃亡过程中不断寻找机会洗清自己的罪名；而T-Bag（罗伯特·克耐普饰）等其他逃犯则因各自的罪行和背景，在逃亡过程中不断发生矛盾和冲突。
《越狱第三季》
越狱第三季中，正当兄弟俩认为他们终于重获新生时，他们被重新拉回原点——这次的越狱将更加危机重重。迈克尔为了帮助被冤枉的莎拉顶罪，进入了巴拿马最凶险的监狱——SONA。这个监狱专门关押一些重刑犯，而且因为几年前发生的囚犯暴乱，当地的军队已经完全撤出，剩下的犯人只能自生自灭。这使得SONA成为一个极度混乱和危险的地方。
就在迈克尔在SONA中努力求生的同时，亚伯拉罕·林肯的儿子LJ和莎拉被神秘组织“公司”的人绑架了。这个组织要求迈克尔和林肯在一周内将在SONA里的澳大利亚人找到并救出来，以此作为交换莎拉和LJ的条件。
为了心爱的女人和侄子LJ，迈克尔和在外面的林肯不得不再次联手，开始新一轮的越狱计划。他们需要在极短的时间内找到并救出那些澳大利亚人，同时还要应对SONA监狱内部的种种困难和危险。在这个过程中，迈克尔和林肯不仅要面对来自“公司”的压力和追捕，还要应对SONA监狱内部的权力斗争和暴力冲突。他们必须小心翼翼地策划每一步行动，同时保护自己和身边的人不受伤害。
《越狱第四季》
越狱第四季中，剧情承接了前三季的故事，继续展现了迈克尔·斯科菲尔德的复仇行动。迈克尔成功从地狱般的索纳监狱逃出后，他的主要目标是找到那些陷害他的人，并揭露真相。他首先前往洛杉矶，找到了格蕾琴和威斯勒，从他们那里得知莎拉其实还活着。这一发现让迈克尔重燃希望，他通过莎拉父亲的好友布鲁斯·贝奈特先生的帮助，成功找到了莎拉，两人终于重逢。
在巴拿马共和国，迈克尔的伙伴们，包括苏克雷、巴里克和T-bag，也在一场骚乱中成功逃出了Sona监狱。他们的逃狱并非仅仅为了自由，更是为了与迈克尔一同揭露真相，洗清自己的冤屈。然而，他们的复仇之路并不平坦。自称国家安全局探员的丹-谢尔夫找到了他们，提出了一个诱人的条件：要求他们与自己合作，搞垮一个名为“公司”的神秘组织。为了换取自由，迈克尔等人决定接受这个提议。他们必须潜入一个神秘的场所，偷取与公司有关的情报。
在这一过程中，他们不仅成功复制了藏有公司秘密的Scylla的信息，还通过一系列的线索和推理，逐渐接近了真相。然而，随着调查的深入，他们发现“公司”的势力远比想象中要大，他们的复仇行动也变得越来越危险。
《越狱第五季》
该季剧情发生了巨大的反转，迈克尔并没有死，而是被一位神秘的敌人波塞冬囚禁在也门的奥吉达监狱，化名为卡尼尔·奥蒂斯，成为了一名恐怖分子。萨拉则嫁给了一位名叫雅各布·内斯的计算机专家，过着平静的生活。当林肯收到了迈克尔的信后，他决定再次前往也门，与迈克尔一起越狱。萨拉得知迈克尔还活着的消息后，也陷入了复杂的情感中，她是否还爱着迈克尔，她的丈夫雅各布又是什么身份。
迈克尔·斯科菲尔德的哥哥亚伯拉罕·林肯以及其他一些之前的狱友也在积极策划救援行动，希望能够帮助迈克尔脱险。他们不仅要面对来自监狱内外的重重困难，还要应对各种突发状况和敌人的阻挠。在越狱的过程中，迈克尔还揭示了一些关于“公司”的秘密，这些秘密不仅与他的冤屈有关，还涉及到更大的阴谋和权力斗争。迈克尔在追求自由的同时，也逐渐揭开了这些秘密。
《越狱特别篇：最后一越》
《最后一越》将讲述众人在《越狱》正剧最后的大结局忽略掉的四年之间发生的事。迈克尔在同伴的帮助下搞垮了“公司”， 但迈克尔脑中还有一个肿瘤。就在他和怀胎八月的莎拉结了婚，还来不及度蜜月享受新婚生活时，莎拉就因为杀了克里斯蒂娜·斯科菲尔德而被捕关进了Miami-Dade女子监狱，在狱中她遇到了格雷琴。而坎特兹将军也被关进了Miami-Dade男子监狱，当不久要坐上电椅的他得知莎拉的境地时，悬赏十万美元加害于她。麦为了自己爱的人和尚未出世的孩子，决定联手哥哥亚伯拉罕·林肯故技重施，帮助莎拉越狱。这一次，他们不得不最后一次铤而走险。
角色介绍
季别主要角色
季别角色内容
第一季
第二季
新增主要角色
第三季
新增主要角色
第四季
新增主要角色
第五季
剧中八大囚犯
剧集制作
作者介绍
保罗·舒尔林（Paul T. Scheuring）美国著名编剧。毕业于加州大学洛杉矶分校，主攻戏剧、电视与电影。最近十年来，保罗创作了数十部电影剧本，如：2003年的《单刀直入》（A Man Apart）,2004年的《浴血森林》（The Rundown）等。《越狱》(Prison Break)是保罗的第一部电视剧本，一经播出，获得极大成功，他也因此名声大振。
角色情况
第一季的林肯只能用无聊来形容，编剧解释这是因为他身处监狱的环境，而且在等待死刑。但第二季因为大家都逃了出来，所以心胸变得开阔，两人可能会根据剧情安排加入更多笑料。“第二季将会看到原来林肯也是个会微笑的人，而迈克尔看到林肯的一些行为后更会捧腹大笑，我想这样的改变将是巨大的。”林肯的扮演者多米尼克·珀塞尔说。
第二季的人物阵型相对第一季来说并没有多大的变化。但是有关这方面最值得一提的是，一个新的人物将出现：Buck Mahone,是一位3、40 岁，四肢发达但头脑绝不简单的FBI特工。他负责追捕逃跑了的七个囚犯。他有与迈克尔十分相似的特质：冷峻的眼神，敏捷的思维。这一角色由威廉·菲齐纳出演。威廉·菲齐纳在美国广播公司(ABC)去年推出的科幻电视剧《入侵》中扮演了一名神经质、似乎被外星人“绑架”过的地方警员。据报道，他也是摆足了大牌的架子，直到《越狱》第二季开拍的前一天才同意签约出演联邦干探这一角色。
在第四季的故事里，增加三个全新的角色，一个是FBI探员丹，在他的帮助下，林肯兄弟组成了复仇团队，包括马洪、苏克雷和贝里克等人，兄弟俩甚至还拉拢了T-bag。新角色中的另一个名为格林，他是一名电脑黑客，将通过自己精湛的电脑技术助林肯兄弟一臂之力。但他同时也是个“大嘴巴”，为兄弟二人惹出不少啼笑皆非的麻烦。
《越狱：第五季》中有好多令人发笑的场景，不过林肯、迈克尔·斯科菲尔德、萨拉以及其他第一季人物的重逢场景，让本季不至于显得特别可笑。如果没发生什么其他事的话，这就是《越狱》系列的最后一季了，这些角色们将成功地退出《越狱》舞台。因为该季没有留什么噱头，二十世纪影业很难再出续集了。
拍摄地点
第一季的FOX RIVER监狱，位于伊利诺伊思州朱利叶市惩治中心，该监狱有百年以上历史，已经于2002年关闭。第二季改在达拉斯拍摄，达拉斯位于得克萨斯州的荒漠上，因为这里远离城市建筑和田园景观，有沙漠也有平原，还有铁路，符合第二季的场景要求，另外这里也是导演桑福·布克斯塔弗的老家。
幕后花絮
迈克尔身上大面积的文身被称为影视作品中最酷的文身，虽然每次米勒要花4个小时来描画它，但因为很有个性让米勒很乐于被文身文满。但实际上，这些文身给他带来的有方便也有困扰。
第四季，复仇成为主基调，“我想我们应该停止逃命，也是时候与公司斗一斗了。迈克尔·斯科菲尔德的扮演者温特沃什·米勒在最近的采访中表示林肯兄弟将会表现得更加强硬。“新一季是令人充满期待的！” 唯一令米勒感到有些不适应的恐怕就是迈克尔将失去他的文身，要知道，文身对于迈克尔来说，就是他的标志。“这条故事线是甜蜜而又苦涩的，让我们很难割舍。”《越狱》的制片人承认去掉迈克尔的文身对他们来说是“困难的事”，毕竟在前三季中，文身几乎定义了整个角色的内涵。
查尔斯·韦斯特莫兰德/D.B.库珀这个角色是根据真实人物D·B·库珀创作的，他在1971年劫持了一架客机，向飞机的主人西北东方公司勒索了20美元，然后跳下飞机，身上绑着21磅20美元的钞票，他从未被找到过，理论上说，他是因为支撑伞打开而丧命的。
剧集特色
《越狱》从开播起就坚持一个信念：一定要连续不断地给观众带来兴奋点和刺激，否则没有什么人能有耐心看完一个超长的“挖地洞秀”。福克斯选中了温特沃斯·米勒作为男一号迈克尔的扮演者，他成了吸引观众持续观看的主要元素。一部纯男人的电视剧、不谈恋爱只讲兄弟情的电视剧。
播出信息
开播时间
收视情况
2005年秋，《越狱》第一季在美国播出时，创下了福克斯电视台7年来最高的周一收视纪录，最多时有1800万观众收看，美国主流媒体纷纷用革命性的突破来形容此剧。此剧在香港特别行政区播出时，一分钟收视百分比更是达到了100%，也就是说那一分钟收看英文台的观众，全部都在看《越狱》。第二季口碑下降，但仍不失悬念，平均收视人数1010万。但第三季开始，编剧似乎江郎才尽，收视率快速下滑，跌到了800多万。第四季第17集更是创下了338万的最低收视率。
2009年4月17日《越狱》第四季复播，首集视频公布当天，在中国的点击率就突破了500万，这还是没有中文字幕的。
音乐原声
获奖记录
剧集评价
媒体评价
正面评价
在美剧迷的眼里，《越狱》不止是一部情节错综复杂、跌宕起伏的好剧，它更是一个时代的标志。因为《越狱》，中国人知道了“季”这个概念，知道网络上有个只干活不拿钱的“义工”字幕组，知道拖沓弱智的韩国偶像剧之外，还有一种极具技术含量以及智慧的美剧。美剧的风潮随着《越狱》开始在中国盛行。（新浪娱乐网评）
《越狱》赢取了无期徒刑犯的心，他们感谢剧中的演员。主角多米尼克·珀塞尔和文特沃斯·米勒的目光仿佛能够击碎砖瓦。如果他们俩的目光不能与上季一样激动人心，那么相信FOX就要在全国被推翻了，还好，从现在来看，FOX无须对此担忧。（《纽约时报》亚历山大·斯坦利）
福克斯频道播放的《越狱》之所以好看是因为它融合了两个类型的经典元素：战友情谊及死刑危机。该剧最大的特点也是它最大的缺点：为了让剧中的罪犯像《胜利大逃亡》(The Great Escape)或《战地军魂》(Stalag 17)中的战士那样结成联盟，刻意将他们都刻画。（新浪娱乐网 评）
负面评价
第一季的《越狱》中充满了不自然和讽刺。第二季最大的问题是：迈克尔想方设法解救了他的哥哥以后会发生什么事情呢？亚伯拉罕·林肯逃狱后，一直躲避狱警的追捕。这也意味着剧集不过是一部寻常的逃犯与警察的剧，我们认为，这部电视剧没有留下什么深刻的印象，除了年轻的迈克尔·斯科菲尔德身上的文身。（《水晶新闻》查理·麦凯伦）
这是一部试图努力变得新鲜，但又只是重复着那些可预测的陈词滥调的电视剧。更糟糕的是，这部戏的宣传暴露了《越狱之亡命天涯》的故事基础只是一个古老的谜和阴谋。我需要的不是让人昏昏欲睡，而是让人振奋的剧情。（《波士顿先驱报》马克·A·派瑞盖德）
《越狱》第三季受到好莱坞编剧罢工的影响，只拍到13集就草草结束。也许好莱坞编剧罢工给了《越狱》第三季不好看一个冠冕堂皇的理由。续集一般都难逃狗尾续貂的评价，《越狱》第二季就已经有了批判的声音，第三季更是让很多剧迷指为“鸡肋”。（搜狐娱乐网 评）
网站评分
衍生作品
分集剧情
第一季
第1集
迈克尔·斯科菲尔德在完成最后一幅刺青的第二天，持枪抢劫银行。被捕后他主动认罪，法官同意其要求，判处他在芝加哥近郊的福克斯河监狱服刑五年。迈克尔被安排在A楼40号牢房，室友菲尔南多·苏克雷主动向他介绍监狱人物，而迈克尔一心想见被判死刑的哥哥林肯·巴罗斯。接近亚伯拉罕·林肯需进入监狱工厂工作，该工厂由前黑帮老大约翰·阿布兹掌控。迈克尔告知探监的律师维罗妮卡，林肯是被诬陷谋杀副总统弟弟，希望她念及昔日与林肯的恋情追查真相。华盛顿哥伦比亚特区的特别探员黑尔和克勒曼因主教迈克莫罗打算为林肯争取缓期执行而担忧。阿布兹接到手下消息，有人知晓将其入狱的证人下落，监狱医疗室的萨拉医生发现迈克尔对胰岛素注射反应异常，迈克尔随即让犯人“便条”帮忙获取伪装Ⅰ型糖尿病所需药物。最终迈克尔如愿进入工厂见到亚伯拉罕·林肯，向他展示了隐藏在纹身中的福克斯河监狱设计蓝图。
第2集
迈克尔向狱友暗示越狱计划，遭维斯特莫兰嘲笑，此时监狱种族冲突一触即发。他从手臂纹身上抄下“施韦策-艾伦11121147”，找到对应序列号的螺丝钉，却被“背包”抢走交给跟班梅泰格。迈克尔·斯科菲尔德告知林肯计划从医院越狱，伪装糖尿病正是为此。蒂姆·吉尔斯向维罗妮卡出示谋杀案现场录像带，维罗妮卡看到林肯向车内死者举枪，林肯则解释当时斯迪曼已死，自己并未扣动扳机。黑尔和克勒曼从蒂姆处得知维罗妮卡重启调查。监狱暴乱中，迈克尔趁机抢回螺丝钉，梅泰格在混乱中被刺身亡，“背包”将此事归咎于迈克尔。迈克尔按纹身图案把螺丝钉磨成螺丝刀，拧开了盥洗设备螺帽。凭借药物通过糖尿病测试时，迈克尔如释重负的表情令萨拉疑惑。回牢房途中，狱警贝里克故意将他留给阿布兹一伙，阿布兹为拷问证人斐波那契下落，命人剪掉迈克尔的脚趾。
第3集
萨拉·唐克瑞蒂医生为迈克尔包扎伤口，迈克尔请求她不将此事报为故意伤害以免影响越狱计划。亚伯拉罕·林肯与迈克尔借工作机会讨论挖掘进度，迈克尔决定测试苏克雷的保密能力。苏克雷思念女友玛丽克鲁兹，看到迈克尔·斯科菲尔德藏有“手机”，在贝里克威胁下说出秘密，实则那是肥皂模型。愤怒的苏克雷被调走，精神疾病患者“铁丝”成为迈克尔新室友。维罗妮卡因忙于调查多次拒绝未婚夫塞巴斯·蒂安的结婚要求，两人最终分手。谋杀案唯一线索兰迪卡遭绑架枪杀，维罗妮卡意识到阻力巨大。阿布兹改变策略，替迈克尔摆平复仇的“背包”，追问证人下落时，迈克尔承诺越狱成功后以斐波那契的消息换取飞机。迈克尔深夜挖掘时，发现“铁丝”正注视着他，“铁丝”称因神经永久性受损从不睡觉。
第4集
“铁丝”持续拒绝服药，对迈克尔的纹身产生浓厚兴趣，不仅四处尾随，还撕扯其衣服临摹。与此同时，苏克雷发现女友玛丽克鲁兹渐被追求者赫克托的谎言蒙蔽，担心刑期届满后失去女友。迈克尔从监狱储藏室和阿布兹处获得两种化学药剂，借注射胰岛素之机倒入医院下水道，药剂发生剧烈反应腐蚀水管。回到牢房后，迈克尔·斯科菲尔德故意撞破额头，成功赶走“铁丝”，迎回同样渴望越狱的苏克雷。维罗妮卡向专门调查死刑案件的“公正工程”办公室求助，尼克协助她发现谋杀案背后牵涉复杂利害关系。黑尔和克勒曼趁机搜查维罗妮卡的家，看到她与亚伯拉罕·林肯、迈克尔的合影后产生警觉，察觉迈克尔入狱过程离奇，决定将其立即转移。
第5集
典狱长亨利·波普起初拒绝迈克尔的迁移令，黑尔和克勒曼用一份机密文件“说服”了他。迈克尔、林肯、苏克雷和阿布兹在工棚核对越狱细节，并未察觉迁移令已获批。迁移令打乱了越狱计划，在维斯特莫兰指点下，迈克尔提出正式申诉，为众人争取到至少30天时间。维罗妮卡与尼克请专家芬克研究谋杀案现场监控录像带拷贝，芬克发现画面无剪辑痕迹但枪声系后期伪造。两人随即申请调用母带，却被告知因水管爆裂导致证据室损毁，母带无法使用。牢房坐便器后的通道已挖穿部分，黑尔和克勒曼以波普私生子的秘密胁迫他毁掉申诉书。与此同时，迈克尔·斯科菲尔德在苏克雷和阿布兹掩护下成功预演越狱，测出所需时间和警方反应速度。就在迈克尔即将被带出监狱时，波普出现将其留下，决心向妻子坦白往事。芝加哥的维罗妮卡发现录像带拷贝被盗，开始怀疑尼克。黑尔和克勒曼向幕后神秘女人报告失败，女人命令他们将注意力转向亚伯拉罕·林肯，称除电椅外还有多种方式干掉死囚。
第6集
迈克尔的挖掘工作遭遇坚实水泥墙阻碍，频繁查房使其无法按计划推进。苏克雷提议挑起骚动，利用防范禁闭期争取时间，迈克尔遂设法让监狱空调系统故障。维罗妮卡和尼克探视林肯，告知当初目击谋杀的匿名报警电话来自华盛顿哥伦比亚特区，虽不足以延期死刑，但提供了新的调查方向。闷热的牢房引发犯人暴动，“背包”带领一伙人遇见林肯和新狱警鲍勃，林肯为保护鲍勃被打昏，鲍勃遭劫持。苏克雷和迈克尔一同进入墙洞加速挖掘，“背包”将受伤的鲍勃扔进他们空牢房，鲍勃撞下坐便器，使迈克尔的越狱秘密被发现。迈克尔和苏克雷闻讯返回牢房，阿布兹和“背包”建议灭口鲍勃，被迈克尔制止。监视器显示萨拉在医院被犯人围堵，迈克尔·斯科菲尔德焦急赶往救援。苏醒的亚伯拉罕·林肯担心弟弟安危，被犯人特克引至无人黑屋。
第7集
监狱暴动持续升级，迈克尔在通风系统中全力向医院攀爬。犯人格斯向波普提出，若不尽快恢复空调系统就对人质鲍勃和萨拉下手。苏克雷警告“背包”不得伤害鲍勃后，独自钻入墙洞挖掘，阿布兹见到越狱通道后也加入挖掘水泥墙的工作。伊利诺伊州州长即萨拉的父亲带着军队抵达监狱，告知波普自己唯一关心的是萨拉的平安，不在乎犯人伤亡。迈克尔终于爬到萨拉办公室通风口，借着犯人焚烧纸张的烟雾将萨拉拉进通风系统。尼克和维罗妮卡抵达华盛顿哥伦比亚特区，发现被害人斯迪曼的能源计划危及石油业各方利益，随即接到威胁电话。亚伯拉罕·林肯在黑暗的蒸汽室与特克搏斗，特克失足摔下20英尺高台死亡，死前未透露谋害林肯的动机。苏克雷和阿布兹合力打穿水泥墙，越狱目标渐近。萨拉在迈克尔·斯科菲尔德帮助下从通风系统逃出牢房区，暴动逐渐平息，但“背包”不顾阻止趁乱刺死鲍勃。救护车内的萨拉开始怀疑迈克尔为何对监狱构造如此熟悉。
第8集
贝里克急于抓住杀害鲍勃的凶手，“背包”威胁迈克尔和阿布兹，若有人供出自己就泄露越狱计划。阿布兹质疑计划，提出如何将单独关押在死囚区的亚伯拉罕·林肯带出，迈克尔说服维斯特莫兰在警卫室放火，众人借清理火场之机挖开下方排水沟。尼克和维罗妮卡回到洛杉矶后，维罗妮卡的公寓发生爆炸，两人侥幸逃生后放弃报警，躲进偏僻小屋继续查案。林肯的儿子里杰与继父艾德里安生活，克勒曼突然出现，争斗中丽萨和艾德里安被枪杀，里杰赤脚逃出，手中攥着拍下克勒曼照片的手机。“背包”指使跟班切利诬告犯人特罗基杀害鲍勃，切利深陷罪恶感。克勒曼和黑尔向副总统汇报，揭露副总统是一切阴谋的幕后主使。
第9集
亚伯拉罕·林肯从新闻中得知儿子里杰背负双重谋杀罪名出逃，想起“父子之中只能活一个”的威胁，恳求波普准许自己在监控下出狱寻子，波普无能为力。一批新犯人抵达监狱，苏克雷观察新人时，迈克尔目睹切利自杀却无力阻止，监狱内另有他人暗中注视着迈克尔等人。尼克告诉维罗妮卡，调查虽危险但不能拖延，决定先找被害人遗孀，认为斯迪曼生前最大的敌人就是幕后主谋。新入狱的混血儿图纳在狱中遭黑人和白人排挤，“背包”借机接近他。阿布兹的威信首次动摇，因迟迟未得到证人下落，黑帮指定同牢房的格斯接替他，其对贝里克的月供中断，监狱工厂也不再由他掌控。亚伯拉罕·林肯最终收到儿子消息，得知里杰摆脱追杀后与维罗妮卡汇合。
第10集
阿布兹敦促迈克尔尽快透露斐波那契的下落，否则无法利用监狱工厂掩护越狱，迈克尔在挽救兄长与危及无辜者生命之间陷入道德挣扎。副总统卡罗琳致电黑尔和克勒曼，对两人工作不满，派奎因前来指导。克勒曼当面指责副总统不该让奎因插手，因奎因代表的“公司”势力远超副总统甚至白宫。迈克尔被迫说出斐波纳契的下落，阿布兹重获监狱工厂管理权。菲利普·法尔佐内带人前往加拿大谋杀斐波纳契，却遭遇大批警察埋伏。迈克尔·斯科菲尔德、苏克雷、阿布兹基本挖穿警卫室废墟下方的排水沟，一直暗中观察的“便条”突然出现，迈克尔的越狱队伍被迫再加一人。维罗妮卡通过聊天软件回复前未婚夫塞巴斯蒂安的问候，却不知塞巴斯蒂安已中弹身亡，奎因正通过网络追踪她。
第11集
迈克尔等人继续挖掘，“背包”无端挑起与“便条”的种族冲突，苏克雷望风时警告众人狱警到来。狱警通知迈克尔有“斯科菲尔德太太”来访，他在夫妻探视室见到妮卡，妮卡交给她一张信用卡。维斯特莫兰被告知女儿患上食道癌仅剩几周时间，法庭却不允许他探望，除非参加葬礼，绝望的他找到迈克尔要求加入越狱计划。尼克告诉维罗妮卡，斯迪曼谋杀案真相不仅关乎亚伯拉罕·林肯生死，还有证据表明副总统从斯迪曼的能源研究计划中挪用数百万资金用于选举。此时奎因闯入两人藏身之处，尼克被击伤，维罗妮卡和里杰艰难挣脱捆绑逃入丛林，将追踪而来的奎因骗入深井。预定越狱时间仅剩四天，迈克尔向林肯透露，经精确计算仅有13分钟逃脱时间，每人需耗时2分钟，但目前越狱队伍已有七人。
第12集
“便条”偷听到迈克尔与林肯的谈话，告知阿布兹和苏克雷将有人被排除在越狱计划之外，阿布兹决定除掉惹事的“背包”。维罗妮卡将失血过多的尼克送入医院，里杰在报纸上看到母亲葬礼公告后偷偷溜出医院。黑尔在墓地发现里杰，克勒曼指示他跟踪里杰寻找维罗妮卡，看着里杰在母亲棺木前痛哭，黑尔内心愈发动摇。在“便条”挑拨下，苏克雷对迈克尔的计划产生疑虑。阿布兹命令手下抓住“背包”，反被“背包”用剃刀割伤喉管。维罗妮卡突然接到黑尔的神秘电话，黑尔表示若她愿继续冒险救亚伯拉罕·林肯，可当晚到高地咖啡屋获取有用信息。迈克尔完成越狱准备，所有管道均已打通，林肯在望风时发现狱警高里向警卫室废墟走来，为给迈克尔争取爬出坑道的时间，林肯动手打了高里。迈克尔爬出洞口后告知众人当晚越狱，与此同时，林肯正被两名狱警拖向单独禁闭室。
第13集
受伤的阿布兹被医用直升机送往芝加哥救治，“背包”庆幸少了一名越狱者，“便条”则补充说少了两人。遭到毒打的林肯被高里关进单独囚室并锁在铁门上。迈克尔询问亚伯拉罕·林肯下落，波普告知他在林肯执行死刑前两人无法再见面，迈克尔提出暂缓越狱先救林肯，遭其他越狱者强烈反对。漆黑囚室中，林肯绝望等待命运降临。尼克告诉维罗妮卡林肯的案子或有转机，建议将发现公之于众。迈克尔用刀片割开纹身，从伤口中取出一枚黑色药丸，通过牧师将藏有药丸和“八点十分吃下去”纸条的念珠转交给林肯。在警卫室干活时，迈克尔故意砸坏水管争取越狱时间。林肯吞下药丸后痛苦昏迷，被送进医务室，迈克尔等人趁机行动，他第一个跳入坑道。黑尔准备向维罗妮卡说出真相时被不速之客打断，维罗妮卡躲在一旁目睹黑尔被克勒曼枪杀。迈克尔在坑道中遇到意外，此前被他做了手脚腐蚀的管道已被更换，他听见亚伯拉罕·林肯的声音后疯狂撬砸管子，绝望中宣布无法逃脱，“背包”递上刀子催促他想办法。
第14集
“背包”拔刀威逼迈克尔必须带众人越狱，但新更换的管道将他们与医务室的林肯隔开。林肯向进入房间的萨拉解释自己因想吐才下床，随后赶来的狱警将他铐在床上。贝里克赶到警卫室，看到刚从地道钻出的迈克尔·斯科菲尔德等人却未发现破绽，只得命令他们回牢房。迈克尔在医务室见到萨拉和隔壁房间的林肯，希望萨拉向父亲提及此案为林肯洗刷冤情，萨拉表示无能为力。尼克和维罗妮卡说服书记官安排法官听取申诉。放风时，维斯特莫兰的话让迈克尔萌生让电椅短路以争取3周时间的想法，一旁的图纳偷听到只言片语。迈克尔在苏克雷掩护下进入地道捉了一只老鼠，随后潜入另一管道。图纳向贝里克提及电椅，引起贝里克警觉，检查后发现高压线路上有一只死老鼠，保险丝已被烧毁。法庭上，因缺乏实质性证据，维罗妮卡和尼克的申诉未获法官认可。迈克尔受命去见林肯刑前最后一面，深感震惊。萨拉找到尼克和维罗妮卡，拿到林肯案的材料后去找父亲州长Tancredi。行刑时间来临，迫于副总统压力，州长致电表示亚伯拉罕·林肯不得赦免，最后一丝希望破灭。维罗妮卡和迈克尔在黄线后先后与林肯拥抱道别，目送他被带往行刑室。
第15集
千钧一发之际，林肯的死刑因发现新证据被凯斯勒法官暂缓。林肯告诉迈克尔，他在观刑室看到了离家近30年的父亲。副总统命令特工凯勒曼和萨曼莎查出情报泄露者，凯斯勒法官顶住压力坚持对泰伦斯开棺验尸。迈克尔不愿坐等调查结果，计划改从与医务室共用管道的精神病人区越狱。副总统在媒体上抨击法官和维罗妮卡的验尸举动，泰伦斯的棺木被掘出送检。因尸体高度腐烂，法医提取牙模与泰伦斯以往的牙模比对，结论为两者完全相同。警卫室墙壁塌出大洞，迈克尔等人百般掩饰才瞒过贝里克。亚伯拉罕·林肯在单人囚室回忆儿时与父亲看球赛的经历，猛然想起一个熟悉的名字。迈克尔在苏克雷帮助下弄到一身狱警衣服，钻进地洞熟悉新路线，通过蒸汽室时被烫伤，衣服粘在身上，回到囚室后只能将其烧掉。医务室护士告知萨拉，迈克尔伤口上的衣物纤维属于警服，迈克尔则向苏克雷说明精神病区的管道图已被烫伤损毁。
第16集
林肯因欠下9万美元债务无力偿还，被迫成为雇佣杀手。动手前他致电迈克尔求助，早已对哥哥自甘堕落失望的迈克尔拒听电话。亚伯拉罕·林肯赶到指定地点时，目标已中枪身亡，最终被警方抓获。维罗妮卡向迈克尔·斯科菲尔德吐露实情，母亲逝世后并无保险金遗留，迈克尔分到的赡养费实则是林肯借来的。得知真相的迈克尔重新认识了哥哥，开始相信林肯被诬陷并着手调查。迈克尔得知林肯将被押往福克斯河监狱执行死刑，而他所在公司恰好拥有该监狱结构蓝图，越狱计划在其脑海中初步形成。几乎同时，苏克雷街头邂逅玛丽克鲁兹，为购买结婚戒指求婚，他持枪抢劫便利店被抓获入狱。萨拉身为医生却厌倦枯燥生活，长期靠注射毒品度日，直到目睹伤者倒地却因毒瘾发作无能为力后幡然醒悟，开始积极戒毒并立志帮助弱势群体。彼时“便条”还是前线军官，因目睹军队虐待战俘并试图揭发被部队除名，为生存偷运私货最终入狱。而“背包”曾以慈父和好丈夫的身份混入一个家庭，女主人苏拉在电视上发现他是背负六条人命的通缉要犯后报警，入狱后的“背包”扬言要报复苏拉。
第17集
烫伤事件后，迈克尔试图凭记忆还原损毁的蓝图，难度极大。萨拉将迈克尔背部有狱警衣物纤维一事报告给典狱长，典狱长询问迈克尔时，他闭口不答被关禁闭。为监视迈克尔等人，贝里克将米勒安插入储藏室工作，并告知苏克雷等人即将撤离储藏室，众人慌乱不已。为掩盖地洞秘密，苏克雷深夜爬出牢房用水泥填补地洞，随后走出室外被狱警抓获。贝里克审问苏克雷，苏克雷按计划谎称是为等待狱外朋友送来女友的内裤才趁乱滞留，贝里克将信将疑地把他关进单独禁闭室。米勒向贝里克告密储藏室地板有异，贝里克赶到时，地洞已被苏克雷修复完好。迈克尔被关禁闭后突然目光呆滞、沉默不语，苏克雷通知狱警找来萨拉，萨拉诊断迈克尔因压力过大精神崩溃，将其送入精神病区。但迈克尔·斯科菲尔德一进入精神病区便恢复常态，原来他装病是为接近对其纹身格外留意的前室友“铁丝”，借助其记忆复原损毁的蓝图部分。另一方面，维罗妮卡等人返回此前藏匿的小屋，发现奎因死在陷阱中，里杰偷偷藏起了从奎因身上找到的线索。
第18集
迈克尔努力启发“铁丝”，希望借助其记忆复原损毁的管道图，“铁丝”逐渐想起过往，迈克尔还教他用催吐法躲过每日必服的镇静药。迈克尔留在精神病区、苏克雷被关禁闭期间，贝里克和高里决定“拍卖”他们的囚室牟利。一名犯人愿出200美元入住，高里承诺24小时内修好漏水马桶，“背包”得知后与维斯特莫兰、“便条”商议，决定不惜代价买下入住权，高里随即把价码提高到500美元。亚伯拉罕·林肯得知儿子里杰被捕后，坚持要亲自劝说儿子听从维罗妮卡安排，维罗妮卡答应为其申请。“便条”筹款未果反遭黑人暴打，“背包”提出通过赌博赚钱。“铁丝”想起了地图，也记起迈克尔曾陷害自己，迈克尔承诺越狱时带他一起走。洗衣房的曼奇看到迈克尔背部伤口，联想到苏克雷归还的警服。一家电器商店内，有人叫尼克“萨维恩”，提醒他不忘职责保持联系。克勒曼告知副总统，林肯的死刑计划遭其父亲干预，副总统决定瞒过公司继续除掉林肯。“背包”和“便条”赌博大胜，高里却再次抬价到700美元，拿到维斯特莫兰的怀表后还出尔反尔，“便条”等人无可奈何。得知越狱计划的曼奇表示有办法让迈克尔·斯科菲尔德回到囚室。亚伯拉罕·林肯获准会见里杰，波普告诫他不得节外生枝，林肯做出保证。迈克尔向波普举报，背部烫伤是高里勒索未果所致，波普搜查高里衣柜，找到钞票、怀表和烫坏的警服，高里被赶出监狱，迈克尔重新回到原囚室。运送林肯的警车在途中被巨型卡车撞翻，车内人员生死未卜。
第19集
翻车后林肯被甩出车外，头部受伤、多处负伤，克勒曼驾车出现，企图捂死无力反抗的林肯。关键时刻，一名神秘男子突然出现打晕克勒曼，将林肯拖走。苏克雷被放出禁闭室，越狱小组重新汇合，迈克尔告知众人医生办公室是出逃必经之路，必须拿到房门钥匙。此时伤愈的约翰·阿布兹归来，以虔诚信徒的模样表示仍愿为越狱提供飞机。贝里克说服波普隐瞒亚伯拉罕·林肯失踪的消息，自行展开追踪。昏迷的林肯被神秘男子带到废旧车处理场藏匿。医务室里，迈克尔突然吻了萨拉，却始终无法下手偷钥匙。苏醒后的林肯认出神秘男子正是自己的父亲，父亲告知林肯，自己为掌控国家大权的“公司”工作，“公司”为阻止他离开才故意陷害林肯。维罗妮卡查阅奎因的通话记录，对蒙大拿州的一个号码产生怀疑。阿布兹找到“背包”，表示愿意勾销“刀片割喉”的旧怨，“背包”心存戒备。图纳不堪同室犯人Avocado的性侵害，用刀片将其划伤。妮卡与萨拉在餐厅交谈时，趁机偷走她的钥匙，探监时交给迈克尔。亚伯拉罕·林肯与父亲的谈话泄露了“公司”更多内幕，父亲表示将与他一同拨乱反正，两人准备离开时，克勒曼和警察闻讯包围了旧车场。克勒曼发现林肯正欲动手，林肯向贝里克自首，父亲趁机悄悄离开。萨拉发现钥匙丢失后很快怀疑到迈克尔，当着他的面让工人更换了门锁。林肯被押回监狱，波普下令24小时监视他。图纳为保命，向贝里克告发迈克尔等人的越狱计划，贝里克震惊之下砸开警卫室地面，发现了地洞。
第20集
贝里克发现地洞后惊骇不已，猝不及防遭维斯特莫兰袭击，打斗后被捆住扔进地道。受伤的维斯特莫兰告知迈克尔，必须在警卫发现贝里克失踪前逃走，迈克尔立即布置任务，众人分头行动，如何带出24小时被监控的亚伯拉罕·林肯成为最大障碍。迈克尔·斯科菲尔德向萨拉坦白越狱计划，请求她下班时不锁办公室门，萨拉无法说服自己告发迈克尔，内心矛盾之下提前离开办公室逃避。副总统因办事不力遭到幕后支持者的斥责和威胁。阿布兹打电话通知狱外同伙准备飞机，并透露仅有三人能成功逃脱。维罗妮卡查出蒙大拿州神秘电话的地址与泰伦斯的公司有关，决定亲自前往，尼克同时接到阿布兹的电话指令。贝里克恢复意识后，拼命挣脱绳索和胶带。众人强烈反对图纳加入越狱，但在迈克尔坚持下只得同意，“便条”将“背包”的刀子交给迈克尔，提醒他提防“背包”和阿布兹。迈克尔从泰姬陵模型上取下一块支柱，获准在禁闭室探望亚伯拉罕·林肯，发现林肯被锁在墙上无法动弹。萨拉从电视上得知父亲有望成为副总统候选人，且其对林肯死刑的态度坚决。迈克尔让苏克雷用“便条”偷来的过氧化物漂洗蓝色囚服。原本无越狱打算的图纳得知室友Avocado当晚返回，终于下定决心准备越狱。各人怀着不同目的，紧张等待越狱时刻到来。尼克最终暴露真面目，举枪对准正要出门的维罗妮卡，维罗妮卡如梦方醒痛骂他是懦夫。波普准备送给妻子的泰姬陵模型突然倒塌，他立即派人寻找迈克尔，此时警卫报告贝里克失踪。波普办公室内，迈克尔拔出小刀，告知波普自己要带亚伯拉罕·林肯一起越狱。
第21集
迈克尔将典狱长软禁在相邻房间，胁迫他打电话通知狱警将林肯送进医务室，并要求其他越狱者七点在自己牢房集合。此前向贝里克告密的图纳向迈克尔保证忠诚，加入越狱行动。监狱外，萨拉最终决定不锁医务室的门，方便迈克尔越狱时进入。迈克尔等人通过管道到达医务室，遇到了凭借记忆找到这里的精神病患者“铁丝”。贝里克的同事发现他的车停在停车场，开始四处搜寻，最终在地下管道中找到他，贝里克随即组织搜捕小组展开行动。所有越狱者中，维斯特莫兰因伤重无法行动被迫留下，曼奇因体型肥胖扯断翻墙绳子未能成功，其余人最终越过监狱围墙。
第22集
监狱高墙上探照灯全部亮起，曼奇被迫供出逃跑人员名单，其他犯人得知越狱成功后欢声雷动、大肆庆祝。贝里克被救出后，立即率领人马追踪越狱者。波普着手调查越狱事件，怀疑监狱内有内奸。维罗妮卡抵达蒙大拿州，驱车前往查到的电话地址。越狱一行人找到阿布兹安排的汽车后，略施小计甩掉“铁丝”继续前行。车内，阿布兹意图对付“背包”，“背包”早有防备，将自己与迈克尔铐在一起并吞下钥匙，阿布兹投鼠忌器只得暂时作罢。为绕过警方检查，汽车陷入泥地无法动弹，众人弃车步行，迈克尔赶走了图纳。与此同时，贝里克发现了丢弃的汽车和图纳的手印。波普追问之下，凯蒂最终说出萨拉对迈克尔有好感。迈克尔等人躲过直升机搜寻，来到一处农家小屋，发现屋内有汽车却无发动机。“铁丝”借走一辆自行车独自逃亡。贝里克找到丢弃的汽车，判断众人尚未走远。等候阿布兹的飞机引起管理员怀疑，管理员派人查询其底细。苏克雷等人按倒“背包”，试图剪开脚镣手铐未果，阿布兹拿起斧子砍断“背包”的手，众人震惊，越狱小组再少一人。“公司”决定用毒药除掉碍事的副总统，恰逢总统意外身亡，副总统侥幸存活，顺理成章接替总统职位。芝加哥警察破门进入萨拉家中，发现她注射过量Morphine倒在沙发上人事不省。维罗妮卡潜入蒙大拿州的房子，意外见到了被指为亚伯拉罕·林肯所杀的泰伦斯。剩余五人突破警方防线向飞机奔去，就在即将抵达时，飞机因等待不及起飞，从他们头顶掠过。发现踪迹的警车正向他们疾驰而来，五人只得继续向夜色茫茫的旷野逃去。
以上剧情参考资料
第二季
第1集
FBI特工亚历山大·麦霍恩受命调查狐狸河监狱犯人越狱案，审阅逃犯资料时格外关注主谋迈克尔·斯考菲尔德。新闻发布会上，麦霍恩列举过往案例，号召全美关注被通缉的八名逃犯。贝里克带领狱警和警犬追击迈克尔等人至铁道边，众人借火车掩护暂时脱身，随后抱怨阿布兹的飞机失约，“便条”提及威斯特莫兰的500万美元，被迈克尔打断。麦霍恩向监狱长波普询问萨拉在越狱事件中的角色，波普告知萨拉因注射过量毒品深度昏迷，生死未卜，而萨拉意识深处不断闪现与迈克尔相处的片段，随后突然苏醒。受伤的“背包”在野营地找到冰块保存断手，继续逃亡。麦霍恩决定从迈克尔的纹身入手调查，贝里克对其介入不以为然。维罗妮卡被困蒙大拿州布莱克斯通的房屋，试图说服遭软禁的泰伦斯摆脱困境，泰伦斯表示只能在此苟延残喘，维罗妮卡用手机报警，泰伦斯未加阻拦。“背包”闯入私人诊所，用螺丝刀逼迫医生马文·古达特为其施行断手再植手术。迈克尔告知亚伯拉罕·林肯，阿布兹的飞机只是计划之一，自己在Ripe Chance Woods另有安排。FBI总部，麦霍恩与纹身师交谈后，开始解读迈克尔纹身中的计划。迈克尔等人被一对父女发现行踪，阿布兹以小女孩相要挟，众人抢得汽车逃离，迈克尔告知“便条”下个目的地是奥斯维戈。麦霍恩前往迈克尔的旧居搜寻线索，贝里克通过信用卡纪录锁定奥斯维戈，率众赶往迈克尔租下的仓库，却发现仓库空无一人，再次被耍。麦霍恩意识到Ripe Chance Woods是人名，此时迈克尔等人已抵达公墓，挖出预先埋藏的衣物换装。麦霍恩随后赶到，众人混入人群得以脱身。一群警察抵达泰伦斯的寓所，正与亚伯拉罕·林肯通话的维罗妮卡被一枪击中眉心身亡。萨拉从护士凯蒂带来的包中发现一只纸鹤，上面是迈克尔留下的便条。
第2集
麦霍恩接到通知，加拿大和墨西哥边境已收到通缉令，将提高警戒严防逃犯越境。迈克尔打扮成大学生在公园偷回食物，与苏克雷、“便条”、阿布兹等人饱餐后续分道扬镳。林肯从报纸上得知儿子里杰的听证会即将开庭，执意要潜入法院营救，迈克尔反对无效只得顺从。“背包”在古达特医生的诊所完成断手再接术，为防止医生报警，给其注射药剂后染发改装，开走医生的汽车前往犹他州。贝里克和波普被排除在追捕行动之外，就越狱事件接受上级调查，被辞退的狱警高里作证称贝里克接受阿布兹贿赂，致使越狱犯得以在警卫室挖洞。波普被扣薪，贝里克遭到解职，波普为贝里克鸣不平而愤然辞职。贝里克回到家中颓废沮丧，一度产生自杀念头，得知亚伯拉罕·林肯等人的悬赏金高达数十万后，决心追踪这群让他蒙羞失业的逃犯。小偷图纳想买票前往犹他，看到通缉令后惊慌逃离车站，在公告牌上找到拼车前往犹他州的女孩信息。林肯冒充律师给儿子里杰打电话，提醒会设法营救，通话被录音。麦霍恩询问里杰电话内容无果，里杰被押走前，麦霍恩突然决定亲自押送。迈克尔和林肯从电梯顶现身，用枪指着麦霍恩的头，让里杰取下他的佩枪，众人拉扯间枪支掉落，麦霍恩抓住里杰阻止其逃走，营救无望，林肯只得松开儿子。麦霍恩控制住里杰，通知警卫上楼顶抓捕迈克尔和亚伯拉罕·林肯，逃跑过程中林肯腿部中弹，流血不止。
第3集
调查员赶到车祸现场，检查烧焦的轮胎和车体残骸，医官哀叹逃犯刚越狱就死于车祸，麦霍恩面无表情询问死者身份。画面闪回12小时前，福克斯河监狱逃犯的照片被挂在墙上，朗警官称已在所有医院布控，同时监视逃犯家人但最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（一）收获。麦霍恩表示逃犯在逃亡最初72小时内必定会犯错，无论是偷车、抢劫还是错信他人，届时即可将其抓获。迈克尔的妻子妮卡听到急促的敲门声，开门发现迈克尔和虚弱流血的亚伯拉罕·林肯，迈克尔扶着哥哥进屋，让妮卡寻找胡椒粉、跌打伤酒、毛巾、止痛药和酒。妮卡慌乱搜寻，迈克尔为林肯处理腿伤，将乙醇直接倒在枪伤处，林肯疼得发昏，喝下伏特加酒，迈克尔又撒上胡椒粉为其消肿，林肯随后昏迷。妮卡责怪迈克尔不该来找她，称警察已在她家附近埋伏多日，迈克尔表示别无选择。迈克尔包扎好林肯的伤口，让妮卡照看，自己外出寻找车辆，林肯建议再偷一部，迈克尔则坚持要找回原有车辆，因车内有逃亡所需物品。迈克尔返回五金店旁的小巷，发现车辆不见，蹲下身捡起一片碎玻璃，目光落在手腕“38 312 1037”的纹身处。
第4集
林肯开车载着迈克尔和妮卡行驶在乡间高速公路上，妮卡在后座询问两人到墨西哥后的去向，迈克尔·斯科菲尔德表示她知道越少越好，到下个小镇就放她下车，并承诺一两周内汇去一万块钱。亚伯拉罕·林肯通过后视镜发现一辆小轿车紧紧跟随且速度越来越快，告知迈克尔，后车随即撞向他们的车辆，妮卡的小车险些散架。林肯竭力掌控方向盘，后车与他们并排行驶，贝里克的奸笑从车窗露出，林肯大惊。吉瑞再次猛打方向盘撞击妮卡的车，妮卡尖叫，林肯踩下油门高速行驶，但车辆性能悬殊无法摆脱。后方驶来一部大卡车，吉瑞被迫让路，迈克尔稍松口气，可卡车很快拐向其他道路，吉瑞再次追上撞击，最终将妮卡的小车撞下路基。三人连滚带爬逃出车辆，迎接他们的是几声枪响，贝里克命令他们不准动，称自己已不再为政府工作。迈克尔·斯科菲尔德以为贝里克是为赏金而来，贝里克却表示听闻他们有财宝，命令三人上车，要带他们去犹他寻找宝藏。
第5集
亚伯拉罕·林肯开车行驶在空旷的高速公路上，收音机播报福克斯河监狱的八名逃犯仅剩七名，约翰·阿布兹昨晚被警方击毙于华盛顿哥伦比亚特区郊外。林肯感叹阿布兹死在最前面，迈克尔则表示前方还有更多未知。林肯提出直接逃到巴拿马共和国，被迈克尔否决，称必须找到查尔斯的宝藏才能顺利逃亡，林肯坦言其他人也会做此判断，两人间出现短暂紧张气氛。迈克尔·斯科菲尔德询问距离，林肯估计还有七八十里路，预计下午可抵达目的地。“便条”在车上与邻座女子闲聊，女子向他展示孩子的照片，“便条”称自己也有一个女儿。特纳和黛布拉狂饮后发生关系，黛布拉憧憬着两人前往夏威夷，特纳告知夏威夷无法开车到达。敲门声响起，特纳紧张地让黛布拉不要开门，黛布拉坚持先查看，发现是一名警官。警官手持特纳的照片询问是否见过，特纳躲在浴室忐忑不安。黛布拉反问警官找特纳的原因，警官称照片中的人刚越狱，有人在附近见过他，黛布拉睡眼朦胧地表示不认识，警官持怀疑态度再次确认，黛布拉肯定地点头后关上门。特纳向黛布拉解释自己只是因偷棒球卡入狱，并非恶棍，黛布拉表示要去散步，将车钥匙放在桌上，称回来时车可能会不见，且警方几小时后大概率会找到被丢弃的车辆，随后离开。特纳抓起车钥匙奔出门外。迈克尔和亚伯拉罕·林肯抵达犹他州的一个小镇，迈克尔庆幸一切顺利，有望天黑前取出宝藏离开，两人开车经过一名手持报纸的男子，该男子正是“背包”。
第6集
“铁丝”将脚踏车停在路边的汉堡包自助售卖窗口前，先被苏打水售卖机吸引，随后冲向朗姆冰糕自助售卖机，尽情享用冰激凌，又用苏打水龙头冲洗尘土，还摆弄巧克力甜浆和草莓酱开关。自助售卖店的门打开，一对情侣进入，未发现“铁丝”便开始亲热，“铁丝”在一旁一边喝苏打水一边观看。女子无意中望见“铁丝”，大叫起来，“铁丝”随即逃跑。林肯将车开到藏有五百万美元的地点附近，发现牧场已消失，迈克尔表示牧场下的五百万或许还在，“背包”抱怨地面标志消失无法定位，迈克尔·斯科菲尔德暴怒地质问其是否记得地窖位置，“背包”称只记得地窖在牧场中央的树林间，且自己没有过目不忘的本领。特纳在后备箱里不停拍打，要求放自己出来，被亚伯拉罕·林肯喝止。麦霍恩在盐湖城的联邦调查局与莱尔·山德谈话，要求调阅三十年前库珀的案卷，莱尔疑惑询问其是否为调查福克斯河逃犯而来，麦霍恩表示逃犯要来起出库珀的钱，需查看案卷。
第7集
“背包”将胳膊塞进珍纳特嘴里阻止其呼喊，迈克尔藏在窗边。珍纳特的女儿安前来探望，未听到回应，转身时发现门口的玻璃碎片，意识到家中出事，遂拔出手枪慢慢走进房间。林肯等人屏住呼吸，迈克尔急寻对策，珍纳特趁机从“背包”手中挣脱并大声尖叫，安举枪对准迈克尔·斯科菲尔德，苏克雷从其身后扑上，被安一肘击翻，林肯随即打倒安并夺下枪支。麦霍恩和莱尔前往五金店察看现场，莱尔认为逃犯早已逃远，麦霍恩则判断只要五百万仍在小镇，逃犯就不会离开，随后指出可通过拷问特纳获取信息。莎拉和凯勒曼一同走向蔬菜店，全程紧张发抖，最终忍无可忍提前离开，凯勒曼注意到她空着的篮子，察觉异常。迈克尔在屋内焦灼踱步，称当前麻烦重重，“背包”建议一不做二不休完成计划，迈克尔回到厨房向珍纳特和安道歉，保证不伤害她们，并让苏克雷看管两人。凯勒曼告知金警官，莎拉似乎对自己产生怀疑，金表示警方和莎拉都了解凯勒曼的身份。莎拉走进州长办公室，见到布鲁斯·贝纳特，得知白宫已撤回对其父亲的副总统提名，稍感安心。“便条”跳进大坑帮忙挖掘，“背包”在一旁翻阅过期的《国家人类学》杂志，其他人则关注电视新闻报道，亚伯拉罕·林肯突然发现特纳离开过久。
第8集
苏克雷举枪对准迈克尔等人，迈克尔让其冷静，苏克雷不为所动，要求众人把装钱的包踢过去，“便条”提醒苏克雷众人可合力发难，苏克雷称自己有足够时间杀死两人，反问谁愿为他人的五百万牺牲，随后拿到包逃跑。迈克尔懊恼不已，“便条”歇斯底里，“背包”暴怒大叫。两人回到厨房，发现珍纳特和安仍被捆在椅子上，迈克尔将一把黄油刀交给珍纳特，告知其约一小时可割开绳索，随后表示不会让“背包”活着回到人群中。返回车库时，“背包”已不见踪影，“便条”提出分道扬镳后奔离，迈克尔拿走安的警察专用无线电联络器，安称警方终将抓住他。莎拉倒在咖啡桌上，慌乱摸索药品，桌上满是半空的Morphine瓶和用过的注射器，一名自称曾与她父亲共事的男子悄悄来到其身后，莎拉认出该男子是杀害父亲的凶手，遂故意打翻物品制造搏斗假象，将男子诱进厨房，用杀虫剂喷向其面部，男子摔倒，莎拉沿消防通道逃走。迈克尔·斯科菲尔德循着发动机声在树林中追赶苏克雷，苏克雷停车举枪对准迈克尔，迈克尔表示拿到钱后会与苏克雷、亚伯拉罕·林肯、威斯特莫兰的女儿平分，到巴拿马共和国后还会给“便条”的家人寄钱，苏克雷打开背包，发现里面全是“背包”之前翻阅的旧杂志。“背包”坐在搭乘的卡车后面，面带笑容，身旁的粗呢旅行袋里装着五百万美元。青少年拘留中心的车停在路边，里杰走下车，警官为其提供住处和工作，远处的林肯暗中观察，被一名流浪汉注意到，里杰拒绝了警官的所有帮助。警官随即致电凯勒曼报告情况，凯勒曼指示其派人监视里杰，目标是抓捕林肯。
第9集
迈克尔压低帽子，卷起袖子，触摸着右肘上蓝黑色花朵的刺青，溜进植物园的后勤区域，趁内部员工离开时从安全门门缝挤入，从衣帽箱取出帽子和上衣换装。一名义工询问换上员工打扮的迈克尔·斯科菲尔德在做什么，迈克尔称夜班经理安排自己换班。迈克尔找到目标地点，假装查看名称牌，发现附近一名双手干净的义工和一名摆弄摄像机、脚边有多个烟头的人，意识到中了圈套，遂慢慢退开。对方逼近过来，一人通过袖中麦克风吩咐埋伏的警员上前，迈克尔穿过一队参观的小学生飞奔逃离，警官因顾忌孩子而减速，最终抓到的只是挂在篱笆上的帽子和上衣。亚伯拉罕·林肯和里杰在高速公路会合，林肯严肃告知里杰仍有自由选择的权利，可分道扬镳过自己的生活，里杰坚持要与父亲在一起。迈克尔坐在小餐馆角落，听到邻座要求女招待调大电视音量，电视中记者询问麦霍恩对大卫·阿波斯金之死的看法，迈克尔立刻坐直身体关注电视。麦霍恩在电视上为自己辩护，称特纳的死会移交相关当局处理，对自己的行为表示懊悔，称办案时总会发生意外。另一名记者询问其是否已修复斯科休德的硬盘，迈克尔起身准备离开，麦霍恩未正面回应，仅含糊表示硬盘信息将警方注意力引向植物园，未透露更多细节。迈克尔由此明白，麦霍恩通过硬盘知晓了所有计划和下一步行动。联邦调查局办公室，郎警官告知维尔实验结果，迈克尔察看的花朵下方藏有一瓶硝化甘油炸药，麦霍恩补充称该炸药的威力足以摧毁一座建筑物。
第10集
“背包”被绑在椅子上，头垂胸前，嘴角流涎，杰瑞将立体声开至最大以掩盖拷打声。吉瑞建议贝利克改变计划，因“背包”似乎什么都不知道，贝利克放下“背包”时，一把存物柜钥匙从其袜子中掉落。联邦调查局办公室内，众人得知亚伯拉罕·林肯在阿利桑那州被捕的消息后欢呼，郎警官尝试联系麦霍恩，却始终得到人工语音提示，凯勒曼联系麦霍恩时亦是如此。金警官最终在间歇时接通凯勒曼，要求其立刻将林肯带到自己这里，凯勒曼不满表示可独自应对犯人。押解林肯和里杰的警车在阿利桑那州公路行驶，一部黑色有篷货车紧随其后，将警车挤下公路，警车撞在树上。林肯踢开车门与里杰拼命逃窜，黑色货车上的人在后追赶，抓住里杰并与林肯搏斗，林肯询问对方身份，一名名叫简·菲利普的金发女郎表示他们站在林肯一边，是其父亲的朋友。凯勒曼一边打电话一边穿过机场拥挤的人群，命令麦霍恩立刻前往阿利桑那州，麦霍恩则称发现迈克尔当天去找了莎拉，需即刻赶往新墨西哥城。日落饭店内，等待与迈克尔会合的莎拉无意识地翻着手袋，发现父亲留给她的一把钥匙，顺手拴在钥匙圈上。黑色货车抵达一座大房子附近，亚伯拉罕·林肯和里杰下车，简的伙伴莱昂怒视着林肯，屋内林肯再次要求见父亲，否则拒绝合作，简称其父亲的飞机一小时内就会降落。麦霍恩向当地饭店服务员出示迈克尔的照片，前台侍者称未见过此人，临行前告知同一条街上还有另一家饭店。莎拉的房门响起敲门声，饭店经理称有传真送达，已成惊弓之鸟的莎拉让其从门下塞进来，传真上仅有“黄油广场路16871号，一小时”几个字。苏克雷站在打开引擎罩的车子旁，尝试修理无果后，灰心丧气地弃车步行。
第11集
被绑在电暖气上的“背包”大声尖叫，拼命挣扎，警察在门口敲门，“背包”看着无法动弹的双手惊慌失措。警察破门而入，却发现“背包”已不见踪影，电暖气上悬着一只断手。迈克尔站在小镇的运动产品商店柜台前，店主为其拿来一盒润滑钓鱼线的油，迈克尔打开发现里面的小瓶子与FBI在植物园搜到的硝化甘油瓶一模一样，随后又索要卫星导航设备，因现金不足仅先拿走润滑油，趁店主招呼其他顾客时抓起卫星导航仪就走，被店主阻拦，两人厮打起来，店主不敌恳求迈克尔不要伤害自己，迈克尔大步离开。亚伯拉罕·林肯的父亲阿尔多与林肯、里杰在科罗拉多州的安全藏身处散步，阿尔多解释自己所在的组织为大机构工作，旨在揭穿总统真面目，原本密切合作的分析师已拿到证明林肯无辜的证据却失踪，相关录音证据仍在，组织认为证据在莎拉手中。此时，利昂用PB消音手枪接连杀害藏身处的守卫，弹壳掉落声引起林肯注意，利昂走进屋内，一番厮打后，林肯用小刀捅死利昂。汽车旅馆里，凯勒曼用下水道软管将莎拉绑在椅子上，称只要她合作就放了她，认为她父亲给过她某些东西，莎拉予以否认，凯勒曼威胁称不合作将承受严重后果，随后脱下外套走向浴室，莎拉听到浴缸放水声越来越大。
第12集
迈克尔望着微笑走来的阿尔多，记忆闸门突然打开，向其怒吼，亚伯拉罕·林肯疑惑询问缘由。原来母亲去世后，迈克尔被寄养在一户人家，养父母对其不好，犯错时经常将他关进壁柜，迈克尔曾尝试用壁橱里的工具开门逃跑，却总被一个人抓住关回，而此人正是阿尔多。迈克尔还回忆起，当时阿尔多将他从养父母家救走时，自己回头望见养父躺在血泊中已死亡。莎拉在浴缸里拼命挣扎，凯勒曼手持电锯走向她，此时房门响起敲门声，宾馆经理探头进来称其他房间客人抱怨电视音量过大，凯勒曼关掉电视，经理却注意到莎拉在浴缸里扑腾的声音，凯勒曼谎称是女儿在玩水。莎拉趁机用牙咬掉浴缸塞子，凯勒曼听见排水声，掏枪冲进浴室，发现浴缸已空，莎拉从门后跳出，将滚烫的熨斗扔到凯勒曼胸前，凯勒曼昏倒在地。莎拉拉开浴室窗户，发现房间位于二楼，犹豫片刻后，见凯勒曼摇晃着站起举枪，便纵身跳下，撞在汽车挡风玻璃上，随后逃离。麦霍恩找到迈克尔和考欧特见面的小屋，看到地上的鲜血、钓鱼竿润滑油和带血的脚印，遂顺着脚印追踪。迈克尔询问阿尔多为何时隔许久才将自己从养父母家带走，阿尔多称自己当时决定背叛服务的组织，为保护儿子们不得不离开，随后告知迈克尔关于雷诺德总统和斯泰德曼谈话盒式录音磁带的事，称组织认为录音带在莎拉手中。凯勒曼因胸前烫伤前往医院，金警官询问莎拉现状，凯勒曼谎称莎拉已死，金要求其发送莎拉的尸体照片。
第13集
亚伯拉罕·林肯举起双手，迈克尔慢慢跪倒在地，麦霍恩的枪笔直对准迈克尔，要求其站起来，林肯请求麦霍恩只抓自己，放了迈克尔，麦霍恩大喊自己谁都不想抓，只想回归以前的生活。突然，一群美国边境巡逻队的警车围住三人，警员通过麦克风命令麦霍恩扔下武器，麦霍恩表明自己是FBI工作人员，警员仍坚持要求其弃械投降，麦霍恩思索后慢慢将枪扔到地上。美国和墨西哥边境上，苏克雷在飞机上指引驾驶员飞往目的地，飞机被警方盯上，无线电传来迫降命令，飞行员和苏克雷携带降落伞跳下飞机。金警官看着电视上亚伯拉罕·林肯和迈克尔被抓获的新闻摇头，凯勒曼坐在车里收听相关消息，神色复杂，FBI办公室内的警官们则为抓捕成功鼓掌。“背包”坐在酒吧里，对着播报抓捕逃犯新闻的电视举杯，转身观察四周时，发现一群战争伤残老兵在此聚会，很多人戴着假手，其中一人指点他前往一家整形诊所。
第14集
凯勒曼击伤麦霍恩，带着迈克尔和林肯逃走，车上林肯认出凯勒曼是一直陷害自己的人，拉住他要动手，询问其让自己不打死他的理由，凯勒曼平静表示自己知道泰伦斯·斯泰德曼的藏身之处，林肯放下对准他的枪。凯勒曼称自己虽陷害过很多人，但现在也成了被陷害的目标，打算与亚伯拉罕·林肯和迈克尔结盟，共同对抗敌人，林肯和迈克尔交换眼神后，回到凯勒曼的车里。麦霍恩醒来，身旁站着一位金发高个子女警员，他告知金警官，击伤自己的是凯勒曼，且林肯兄弟仍活着。泰伦斯·斯泰德曼在屋内踱步，看着电视上林肯兄弟逃脱的新闻，抱怨警方未兑现让他回归正常生活的承诺，陪伴他的警员称待在屋内才安全，泰伦斯不听劝告。麦霍恩不想再为金工作，打算退出，女警员提醒他与金之间有协议在身。此时麦霍恩接到妻子电话，得知儿子被车撞断腿，遂收拾东西离开医院，在路上挥手拦出租车却无人敢停，回头发现女警员冷漠地站在身后，女警员称骨折虽麻烦，但比起皮肤和软组织感染不算严重，麦霍恩明白这是对方用家人性命威胁自己留下，愤怒地朝女警员挥拳，女警员毫无反应，命令他继续工作。
第15集
电视紧急插播新闻，称越狱的亚伯拉罕·林肯兄弟向电视台提交了一卷录像带，即将播出，录像中林肯直视镜头表明自己名叫林肯·巴罗斯，是清白的。六小时前，麦克和林肯站在泰伦斯的尸体前，凯勒曼朝他们大吼，称此处无其他出口，指责他们开新闻发布会前未找带后门的办公室，外面警员用大喇叭命令兄弟俩立刻出来，摄影记者也打开了摄像机。凯勒曼炸开房门，向警察出示徽章，表明自己是联邦警员，迈克尔和林肯是其俘虏，要求当地警察放下枪以便安全带出俘虏，随后迈克尔和林肯在其监视下慢慢走出。一名警察要求查看凯勒曼的证件，靠近时被凯勒曼抓住当作人质，用手枪指着其头部，警察们纷纷举枪对准他，几人在人质掩护下开车逃离。亚伯拉罕·林肯驾车在泥泞道路上狂奔，凯勒曼在后座对摄影记者说，若对方保证不动，就不伤害他，迈克尔查看车窗外面，收听收音机里的新闻报道，林肯想与凯勒曼分道扬镳，迈克尔则认为凯勒曼仍有用处。
第16集
莎拉走出火车，四处寻找迈克尔，凯勒曼在远处监视，此时接到总统来电，总统告知自己已抵达芝加哥，要求凯勒曼除掉迈克尔和林肯，以掩盖所有真相。莎拉终于看到迈克尔，两人紧紧拥抱，莎拉向迈克尔展示挂在颈间的关键钥匙，称无法辨认钥匙上的花纹徽记，迈克尔朝凯勒曼使眼色，示意需要向莎拉解释双方合作的情况，莎拉顺着目光看到凯勒曼，身体瞬间僵硬。凯勒曼向莎拉诚恳致歉，莎拉虽不情愿，但深知别无他法，只能选择合作，一旁的迈克尔和亚伯拉罕·林肯兄弟却怒火中烧，迈克尔将凯勒曼搡到火车站墙角，低吼指责他曾留下莎拉独自等死，凯勒曼被扼得喘不过气，挣扎着表示迈克尔仍需要自己，莎拉却冷冷地说他们无需与凯勒曼合作，钥匙的秘密自己可以解开。凯勒曼看到莎拉颈间的钥匙，连忙表示自己知道钥匙的用途，称其是一家私人雪茄俱乐部的门钥匙，林肯询问俱乐部地址，凯勒曼揉着被勒痛的脖子回答在芝加哥。火车上，凯勒曼冒充警察，请求检票员帮忙腾空一节车厢，称自己在掩护证人前往芝加哥，莎拉独自坐在一旁，亚伯拉罕·林肯走上前安慰她，称危险很快就会过去，保证一旦不需要凯勒曼就立刻除掉他，并为连累她陷入麻烦致歉，表达感激之情。
第17集
莎拉走进雪茄俱乐部深处，打开存放会员私人雪茄盒的房间门，望着一墙的会员私人抽屉，不知哪个属于自己的父亲，此时经理打来电话要求与其谈话。外面等候的迈克尔翻阅俱乐部宣传册，看到某些信息后凝神思考，无意中瞥见一部警车驶过。莎拉正准备走向经理，突然改变主意奔向前门，迈克尔也起身准备离开，趁机偷了一个人的手机，两人在走廊相遇，迈克尔示意快走，随后一同奔进厨房，从紧急出口逃离。他们刚躲进小巷，身后的警车就打开车灯追来。麦霍恩与儿子通电话，询问伤势并致歉，称自己本应放下一切前去照顾。迈克尔和莎拉逃回车里，告知亚伯拉罕·林肯和凯勒曼未在雪茄室找到任何东西，必须返回俱乐部重新搜索，否则敌对组织发现后会利用权势销毁证据，迈克尔表示已找到帮手，将俱乐部宣传册递给林肯，林肯看到会员页上的“波普”字样喃喃自语。亨利·波普在家中听到敲门声，微笑开门却意外见到莎拉，莎拉表示有重要消息要告诉他，波普称毫无兴趣并希望她尽快离开，莎拉恳求给予五分钟时间，承诺之后立刻离开，波普询问“我们”指的是谁，此时迈克尔出现，波普震惊不已。
第18集
计算机开始播放声音文件，麦克、亚伯拉罕·林肯、莎拉屏息聆听，播放完毕后莎拉震惊不已，林肯在房间内踱步思索。林肯对麦克和莎拉说，若将录音文件交给媒体，政府必定会否认其真实性，就像之前否认他们提交的录像带一样，麦克表示可寻求父亲曾在政府工作的同事帮忙扳倒总统，林肯想到父亲的前同事珍妮·菲利普斯，她现在是里杰的监护人。与此同时，芝加哥的荒废小巷里，一名男子递给凯勒曼一把枪，凯勒曼仔细检查后，将一大叠钱放在男子手中，随后走回卡车，用装有静音器的手枪瞄准男子射击，男子倒地后，凯勒曼又补了一枪。此时，“便条”正对着手提电脑，屏幕显示网站，这是麦克当初要求逃生者记下的联络网站，“便条”已在上面给麦克留了多条信息，马霍在房间内监视着“便条”，渐感不耐烦。“便条”告诉马霍，麦克十分机灵，能轻易识破联邦警员的常规伎俩，若见面时发现陌生面孔会立刻溜走，马霍则认为麦克是实际的人，逃生后不会按约定查看该网站。房间电话响起，里杰接起，亚伯拉罕·林肯询问其情况，里杰称一切安好，林肯满怀歉意地表示遗憾许久未联系，并称已找到可证明清白的证据，有望阖家团圆，里杰翻了翻白眼，打断父亲的话，称自己已用化名重新上学，交了新朋友，适应了新环境，请求父亲除非确认洗刷清白，否则不要再打电话，失望的林肯让他将电话转给珍妮。
第19集
“便条”的身体悬在空中摇晃，神智逐渐不清，路过的哨卫发现后，立即打开牢门，剪断绳子将其救下，哨卫准备去叫医护人员，“便条”却喃喃自语要求让自己死。支持者聚集在旅馆门口，挥舞旗帜和标语欢呼，等待总统卡罗琳·雷诺德出现，凯勒曼在另一幢大楼上举枪瞄准下方，同时通过耳机监听警卫布防。麦克感谢库珀·格林的帮助，目送其离开旅馆房间后，对亚伯拉罕·林肯说还差十分钟，林肯点头表示需抓紧时间，马霍走下台阶奔向他们的旅馆房间。林肯告知麦克，若下一步计划失败需立刻逃走，麦克表示全靠他，林肯称有个名叫德瑞克·斯威尼的人会帮忙安排逃生，麦克表示赞同，随后与莎拉约定下午3点15分见面，告知莎拉和林肯自己爱他们，便步出房间。马霍抵达十层，潜入大厅，向旅馆工作人员出示警察徽章索要房门钥匙，旋动钥匙后发现门链插着无法进入。莎拉看到房门自动打开，察觉不妙，连忙找地方躲藏，马霍一脚踢开房门，举枪在房间内四处搜寻，最终失望地放下枪，因兄弟俩再次逃脱，此时他注意到地上的电脑线。莎拉藏在床下，看着马霍的鞋子在房间内走动，大气不敢出，听到房门关上后，稍等片刻才钻出来，拿出手机准备打电话，走到房间拐角时，突然看到马霍端着枪站在那里，马霍脸上写满失望，命令她坐下，莎拉称不知道兄弟俩的去向，因为他们认为这样对自己最安全。
第20集
芝加哥附近的码头，麦克和亚伯拉罕·林肯走下车辆，他们预定了前往中美洲的船，船即将启航，林肯为成功扳倒总统感到开心，麦克却仍忧心忡忡。林肯告诉麦克，当初弟弟说要将自己救出福克斯河监狱时，自己毫无希望，如今麦克的计划几乎百分百实现，只需完成最后的收尾工作，随后林肯跳上船，麦克慢慢跟上。莎拉开车前往码头与麦克会合，麦克已准备登船，莎拉打电话告知五分钟内必到，麦克表示已买好船票，让她一同上船流浪，莎拉身后的朗警官致电马霍汇报情况。林肯在甲板上找到麦克，麦克仰望天空，担忧尚未赶来的莎拉，莎拉从后视镜发现被车辆跟踪，转过街角后发现对方紧追不舍，驶近码头时又发现另一部跟踪车辆，遂将车停在一栋老旧建筑旁。麦克打来电话询问情况，莎拉一边观察跟踪车辆，一边看向指向码头的标志，深知自己无法冒险让麦克重新入狱，便谎称自己已上船，让他立刻动身，两人在船上会合，随后挂断电话并说爱他。麦克环顾空无一人的四周，明白出事了，此时莎拉打开车门，举起双手，朗警官上前为其戴上脚镣手铐，马霍在不远处看着这一切，神情凝重，随后走近莎拉询问兄弟俩的下落，莎拉装傻充愣，一言不发。船渐渐驶离码头，麦克在船上焦急地寻找莎拉，亚伯拉罕·林肯指向码头汇集的警车，两人明白莎拉已被捕，冲动的麦克要求船立刻掉头，被林肯制止，只能无奈旁观。
第21集
林肯跑下码头，呼喊麦克的名字，却发现麦克已不见踪影。“背包”在酒店房间里神经质地踱步，抓起一张写有“奥莉维娅大道312号，第二层，红色门”的纸揉成一团扔出，纸团落在一把手枪旁。“背包”走到小阳台观察街道动静，看到电话亭旁戴着兜帽的麦克正遮住面孔等待自己，麦克虽清楚记得“背包”在监狱和逃亡中的所作所为，但当下仍需要他的帮助。阳台上的“背包”未认出麦克，却注意到两名佩枪男子在桌边用餐，麦克也察觉到这一情况，机敏地扫视四周，看到一群孩子在踢足球，随后盯住电话亭旁的垃圾箱，一个计划在脑海中形成，抬头时恰好看到“背包”转身回房。一部出租车驶向巴拿马城，后座的马霍致电前妻帕姆，告知自己已出国，称此前承诺过会离开FBI，如今时机已到，询问两人是否有破镜重圆的可能，帕姆表示无法确定，马霍激动不已，发誓要把握最后的机会，随后又打了一个电话询问对方是否准备好，接听电话的正是“背包”在阳台上注意到的两名男子之一。马霍称自己马上就到，挂电话前突然听到枪声，两名男子立刻拔出靴中手枪，环顾四周后发现是鞭炮在垃圾箱里爆炸，面前的垃圾箱冒着青烟。麦克看到两人的反应后转身离开，递给手持鞭炮的小男孩十美元，随后钻进超市。
第22集
麦克在船的上层甲板踱步，焦虑思考马霍的条件。一名巴拿马共和国少年端着杂货箱上前叫卖糖果和啤酒，被麦克拒绝，少年四顾无人后悄悄询问是否需要兴奋剂，麦克将其打发走，随后接听响起的电话。电话是马霍打来的，提出为其提供钱和船只，麦克犹豫询问是否会放走亚伯拉罕·林肯，并称记得马霍曾放走特纳等人，马霍表示情况已变，如今双方拥有共同的敌人，称自己能给予麦克自由，麦克的自由也同样掌握在自己手中。麦克停顿片刻后，告知马霍需要一天时间才能抵达其扣留林肯的码头。林肯嘲弄地询问马霍逃亡的滋味，马霍平静表示自己会活下来，林肯称他终将得到报应，马霍未予理会。凯勒曼坐在证人席上，向法官和陪审团表示，自己所说的话可能会让自己入狱，但仍要说出真相，因为自己冤枉了不该冤枉的人，随后陈述了自己陷害亚伯拉罕·林肯的全过程。
以上剧情参考资料
第三季
第1集
新一季剧情始于巴拿马共和国索纳监狱，这里关押的皆是穷凶极恶之徒，法律形同虚设，狡猾的毒贩莱切罗是监狱内的首领。迈克尔、马宏等新进囚犯被带去拜见莱切罗，莱切罗早已听闻迈克尔的事迹，对其表现出极大敌意。马宏向迈克尔示好并提议一同越狱，遭迈克尔拒绝，二人在此期间见到了老伙伴T - Bag。前狱警贝利克同样被投入该监狱，过着食不果腹、衣不遮体且被迫打扫厕所的凄惨生活，他在狱中见到神秘人物韦斯勒，韦斯勒要求贝利克为其办事，并以食物作为交换。监狱内的争端通过“鸡爪子”即生死相搏的方式解决，迈克尔遭人陷害，需与一名黑大汉决斗。此时贝利克出现，将韦斯勒给他的两张字条分别塞给决斗的两人。在马宏的协助下，迈克尔赢得决斗，黑大汉的尸体被抬出监狱，等候在外面的女子索非亚打开字条，上面写着一串数字和词语。监狱外，亚伯拉罕·林肯一方面设法营救迈克尔，另一方面寻找莎拉和儿子LJ，偶然间接到LJ的电话，得知LJ已抵达巴拿马共和国并要求见面。林肯赶到约定地点，见到的却是一名陌生女子，对方告知莎拉和LJ已被绑架，唯有将韦斯勒救出索纳监狱，才能保住莎拉、LJ和迈克尔的性命。林肯与迈克尔见面后，将此事告知了他。
第2集
索纳监狱自上次暴动后便一直水资源紧缺，莱切罗的权威也因此受到挑战。迈克尔从贝利克口中得知韦斯勒正躲在下水道内，便赶去告知韦斯勒自己入狱的目的就是将他救出。监狱外，神秘女子苏珊再次与亚伯拉罕·林肯见面，要求林肯在一周内将韦斯勒救出监狱，并需随时向她汇报越狱进展。苏克雷登场，与贝利克碰面后用枪威胁对方，最终得知贝利克并未抓住玛丽克鲁兹。监狱内，其他几名美国人也发现了韦斯勒的踪迹，马宏从麦迪处得知韦斯勒的藏身地，贝利克和T - Bag则将此消息出卖给莱切罗。三方人马在地下水道剑拔弩张，迈克尔、马宏以及莱切罗的人马对峙，韦斯勒最终被马宏抓住。监狱内随即发生暴动，迈克尔设法打通监狱水道，不仅拯救了韦斯勒，也巩固了莱切罗的权威。林肯根据字条上的线索维拉银行，马德里，1989追踪到韦斯勒的女友，并抢到一本鸟类指南。
第3集
亚伯拉罕·林肯将莎拉和LJ的照片交给迈克尔，迈克尔让林肯告知苏珊，自己必须与莎拉通话，并策划让林肯前去营救莎拉和LJ。为与莎拉通话，迈克尔威胁T - Bag，从莱切罗处“借”来手提电话，莱切罗虽未察觉是迈克尔和T - Bag偷用电话，但最终还是发现电话被动过。莎拉在通话中向迈克尔暗示了自己的位置，林肯赶去寻找，却未能成功营救，莎拉和LJ再次被绑匪带走。久未服药的马宏愈发不安，向律师索要药物遭拒。韦斯勒找到马宏，打听迈克尔的情况，随后向迈克尔透露了自己入狱前的遭遇，他曾结识一名类似自然学家的人，此后便不断有人要求他带领前往该自然学家去过的地方，其中不乏政府官员。营救失败的亚伯拉罕·林肯陷入绝望，迈克尔则开始认真策划越狱计划并似乎发现了线索。急于离开监狱的马宏再次向迈克尔提议合作，遭拒后威胁要杀死韦斯勒，这番对话被贝利克听到。莱切罗察觉到身边的人有异心，怀疑有人企图夺取他在监狱的统治权。监狱二把手看不惯阿谀奉承的T - Bag，处处针对他，T - Bag也开始谋划反击。林肯回到公寓，在门口见到决意离开玛丽克鲁兹后一直要求与他一同找回钱财的苏克雷，随后接到苏珊的电话，并发现了一个带血的箱子。
第4集
亚伯拉罕·林肯陷入崩溃，带血的箱子里装的竟是莎拉的头颅，苏珊进一步威胁，若再耍花招，LJ也将性命不保。林肯无奈再次与迈克尔见面，却不敢告知莎拉的死讯。迈克尔则一心筹备越狱计划，他借来麦迪的十字架，让马宏寻找一支黑色钢笔，同时要求林肯找到掘墓人帮忙。迈克尔利用十字架制造停电假象，成功提出更换牢房的要求。贝利克偷听到迈克尔的计划，想趁机入伙遭拒，试图出卖秘密却偷鸡不成蚀把米。监狱外，林肯向苏珊汇报越狱计划，并前去收买掘墓人，不料掘墓人出尔反尔，苏珊为保密将其射杀。索非亚得知兄弟俩的计划后找到亚伯拉罕·林肯，要求一同行动，苏克雷也得知了莎拉的死讯，最终决定替代掘墓人参与越狱计划。苏珊从林肯手中拿到真正的鸟类指南，将其寄给韦斯勒，指南中夹着一张字条写着你时间不多了。
第5集
越狱准备工作紧锣密鼓地推进，迈克尔设法获取了微波炉、手表和望远镜，试图通过观察守卫的日常规律寻找越狱机会，计划在次日球赛期间实施越狱。就在迈克尔、韦斯勒和马宏忙碌之际，内外条件发生变化，一名神秘新囚犯出现，他似乎认识韦斯勒，并开始观察几人的举动。监狱外，假扮新掘墓人的苏克雷受人利诱，需向监狱内运送物品，而接收物品的正是莱切罗的马仔之一。迈克尔发现一名狱警是体育迷，值班时会看电视，便想利用微波炉的EMP脉冲干扰狱警视线，却弄巧成拙被发现。狱警搜查时发现了迈克尔等人的望远镜，危急时刻，韦斯勒巧妙地以鸟类指南作为证据，帮助众人逃过一劫。危机暂时解除，但越狱计划被打乱，时间愈发紧迫。正当众人一筹莫展时，马宏从丢弃的纸杯上发现了新的越狱契机。
第6集
越狱准备进入最后阶段，当天下午三点，马宏、迈克尔和韦斯勒将撬开一间囚室的铁窗，利用吊床制作的绳梯越狱。监狱外，亚伯拉罕·林肯等人负责迷倒一名守卫，另一名守卫则会被午后阳光遮挡视线。新来的囚徒帝格坚决指认韦斯勒曾以麦克法登的名字在尼斯担任外交官，随后帝格被神秘谋杀。为维护监狱规矩，莱切罗因韦斯勒与帝格有矛盾而将其当作嫌疑犯抓走，迈克尔却发现真正的凶手是马宏。与此同时，马宏以前的同事来访，提出以马宏出庭做污点证人为条件换取减刑，马宏最终同意并离开了索纳监狱。林肯的意图被苏珊识破，他不得不将越狱计划告知苏珊，并承诺不再耍诈，同时也无法再向迈克尔隐瞒莎拉的死讯。迈克尔悲痛欲绝，做出惊人决定，公开宣称莱切罗是一切祸事的根源，并要求与他决斗。
第7集
决斗实则是幌子，迈克尔虽深陷悲痛，却想借决斗的喧哗掩盖越狱意图，计划在下午三点决斗时刻暗度陈仓实施越狱。然而事与愿违，尽管一名狱警被成功迷倒，但阳光并未提供足够的掩护时间，迈克尔和韦斯勒只得暂时退回囚室，且来不及掩盖越狱痕迹。两人最终被迫决斗，就在韦斯勒即将对迈克尔实施致命一击时，狱警循迹而至。狱警杀死一名囚徒以示警告，并告知莱切罗若无法管好囚犯，将找人取代他的位置。暴怒的莱切罗抓走迈克尔，令人意外的是，他竟要求迈克尔继续推进越狱计划，并带自己一同离开，因为他在监狱的统治权已岌岌可危。监狱外，越狱失败后，亚伯拉罕·林肯试图强行抢夺人质，却与苏克雷合力也未能救出LJ。苏珊前往监狱探访神秘人，此人正是韦斯勒，韦斯勒要求苏珊多给兄弟俩四天时间，这一幕被迈克尔看在眼里。
第8集
苏珊同意给兄弟俩四天时间重新筹划越狱，但组织已失去耐心。将军出现，要求苏珊强行救出韦斯勒，至于兄弟俩和韦斯勒的女友，已无利用价值。监狱内，守卫正用强化钢加固各处窗门，莱切罗与迈克尔等人继续谋划新的越狱计划。莱切罗与迈克尔虽为利益暂时结盟，却各怀心思，韦斯勒更是心怀鬼胎，他已知晓组织会强行营救自己，只需在五点抵达天台即可。迈克尔通知亚伯拉罕·林肯他将面临危险，历经枪战后脱险的林肯和苏克雷告知迈克尔，组织已派出杀手。迈克尔随即意识到组织另有营救韦斯勒的方法，他冲到天台阻止了韦斯勒逃跑，组织派出的两架直升机只得无功而返。守卫被此次越狱事件彻底激怒，认为一切皆因迈克尔而起，决定将他带离索纳监狱，迈克尔的命运再次陷入迷雾。
第9集
索纳监狱迎来新监狱长，其高压政策迫使迈克尔说出全部真相。监狱长起初不信这个离奇的故事，将韦斯勒也抓来对峙，韦斯勒不堪刑罚最终招认参与越狱。监狱外，亚伯拉罕·林肯夹在苏珊和迈克尔之间左右为难，苏珊出现并带他见到LJ，展现出一定的善意。苏克雷为养活家人，再次接受向索纳监狱送货的差事，他并不知道所送盒子里装有一把手枪，监狱内外正策划着针对莱切罗的阴谋。迈克尔设法联系到林肯，凭借这条线索，监狱长成功抓获苏珊。苏珊、韦斯勒、迈克尔三方对峙后，监狱长终于相信真相，随即派人营救LJ。然而事情并未顺利推进，苏珊将众人引入陷阱，杀害了监狱长，再次以LJ的性命威胁林肯。监狱长死后，韦斯勒和迈克尔重返监狱，加上此前回归的马宏，一切似乎回到原点。
第10集
T - Bag和贝利克加入越狱计划，此时萨米成为监狱领导者，T - Bag希望贝利克用同样的方法除掉萨米，无奈贝利克的丙酮已经用完。萨米悬赏迈克尔的首级，很快便发现迈克尔的越狱企图。幸运的是，迈克尔在计划破坏隧道时，萨米因隧道塌陷丧命，莱切罗重新夺回监狱统治权。
第11集
格雷琴绑架索非亚，逼迫韦斯勒向公司交出他们想要的情报。迈克尔遭到威胁，越狱时间被提前至当晚。麦克格雷迪加入越狱行动，T - Bag与莱切罗结成联盟，贝利克则希望与马宏结盟，亚伯拉罕·林肯和苏克雷在监狱外提供协助。然而苏克雷因化名问题遇到麻烦，仅延迟三十秒，越狱计划便遭遇严重威胁，贝利克、莱切罗和T - Bag威胁迈克尔，要求先让他们逃跑，否则就杀死韦斯勒。
第12集
莱切罗、贝利克和T - Bag正要逃跑时，电源突然恢复，三人被当场抓获，莱切罗受伤。迈克尔、韦斯勒、马宏和特雷西·麦克格雷迪则趁机成功逃脱，在水中躲避公司的追查。正当林肯与格雷琴协商新的交换协议时，韦斯勒因恐惧逃跑。
第13集
迈克尔和亚伯拉罕·林肯很快抓获韦斯勒，计划用他交换LJ和索非亚的性命。迈克尔将交易地点选在博物馆，打算在公司人员离开前将其枪击制服，并制定了相应的逃跑计划。然而交易过程中，索菲亚中枪，迈克尔与公司人员陷入混战。麦克格雷迪回到哥伦比亚与家人团聚。索纳监狱的警察发现苏克雷的真实身份后，将其投入监狱。T - Bag杀害莱切罗后，企图夺取监狱最高统治权。马宏决定再次加入公司。索菲亚的伤势逐渐好转，迈克尔离开林肯，决心寻找格雷琴，为莎拉报仇。
以上剧情参考资料
第四季
第1集
Michael在洛杉矶筹备为公司杀害Sara实施报复的计划，他跟踪Gretchen和Whistler至一家酒店，二人正试图窃取公司的数据卡，Whistler暗中拷贝了卡片而未告知Gretchen。Michael悄悄尾随并以杀死Gretchen相威胁，Gretchen随即告知他自己伪造了Sara的死亡消息，此时警察赶到，三人慌忙逃走。Pad发现Whistler交给自己的是复制卡后震怒，命令Wyatt射杀Gretchen。在巴拿马共和国，Michael将Sara尚在人世的消息告知Lincoln，他登录European Goldfinch网站，看到Mahone因Sara相关事宜希望与他见面的信息。Mahone与Whistler同属一家公司，Whistler手中的Scylla数据卡记载着公司代理人名单，二人需要Michael协助闯入公司，并告知他Sara可能在芝加哥。话音刚落，Whistler便被Wyatt射杀，Scylla卡也被夺走，Pad下令Wyatt清除所有与Whistler有牵连的人。靠近墨西哥边境处，Bellick和Sucre被Bellick的母亲所救；与此同时，巴拿马共和国的T-Bag雇人驾车穿越边境寻找Michael，他凭借一本鸟类书笃定能与Michael相遇。Mahone致电科罗拉多州的前妻Pam，Pam希望他回家，而Wyatt随后强行闯入了Pam家中。Michael前往芝加哥寻找Sara的亲友Bennett，却被当地警察逮捕并带到Self面前，Self与Whistler曾共事，他提出可抹除Michael和Lincoln的犯罪记录，条件是二人协助他获取Scylla卡。Mahone回到Pam家时，发现这里已被警方和医护人员封锁；另一边，Sucre前往医院探望Maricruz和新生儿，警方当场逮捕了他与Bellick。Self向Michael和Lincoln提出由他幕后支援，让二人联合Mahone、Bellick、Sucre等旧友执行任务，目标是获取数据卡并闯入公司总部，称这是唯一的出路，二人起初拒绝相助。随后Bennett带领Michael和Lincoln见到了躲藏起来的Sara，为避免牢狱之灾，Michael不得不答应协助Self，Sara担心永无宁日，希望他彻底击垮公司，而Sara背上的伤疤更坚定了Michael的决心。此时公司人员发现了他们的藏身处并开枪射击，Lincoln、Michael和Sara紧急撤离，随即致电Self让其赶来支援。最终，Lincoln、Michael与Mahone、Bellick、Sucre在芝加哥警署会面，众人知晓T-Bag持有那本鸟类书，Self为他们提供了伪造的身份证，Michael也去除了身上的纹身，Sara与众人一同登上货运飞机，跟随Self开启了对抗公司的行动。
第2集
Wyatt向Pad汇报，亚伯拉罕·林肯和迈克尔均被关押在最高安全级别的联邦监狱服刑。Self带领Michael一行人抵达洛杉矶，为每个人安装了踝关节GPS监测器，将落脚点设在港口附近的一座仓库，黑客Roland将协助他们寻找并解密Scylla。T-Bag在途中被雇佣的司机抢劫后丢弃在墨西哥沙漠，他步行前往圣迭戈寻找Michael，途中被一对骑行者救助。Roland缩小搜索范围至本地工作的军人信息，Mahone认出了目标司机，众人跟随司机来到Tuxhorn的住所，该住所由全副武装的警卫守护，戒备森严。ROLAND提议使用无线硬盘设备在10英尺范围内复制数据卡信息。为接近Tuxhorn，Sucre和Bellick故意撞上他的车，Sucre携带硬盘机与司机争执以靠近Tuxhorn，但Roland始终未接收到信号，无法完成拷贝。Wyatt威胁监狱工作人员打探迈克尔和亚伯拉罕·林肯的移送情况，得知二人已被Bennett保释。Sara在公共汽车站与Tuxhorn的女佣相遇，趁机将设备偷偷放入女佣的手提包。随后，在女佣准备离开Tuxhorn住所时，Michael致电该住所，谎称自己是安全局人员，让女佣检查所有窗户，女佣提着装有设备的手提包在屋内巡查，Michael指示她前往书房，Roland此时捕捉到信号并开始拷贝Scylla。女佣返回公共汽车站等候时，Bellick抢夺了她的包，却发现设备不在包内，原来设备仍留在屋内，女佣误以为那是老板的物品。众人不得不计划闯入Tuxhorn的住所，Sucre按响街对面的警铃，住所内的美国国民警卫队陷入混乱，Tuxhorn关闭警铃并外出查看，Mahone和Michael趁机潜入屋内寻找设备，在Tuxhorn重新启动报警器前成功逃出。Wyatt前往Bennett家中，Bennett明确表示不知迈克尔和亚伯拉罕·林肯的下落，Wyatt随即刺伤了他的脖子。Gretchen并未死亡，而是被囚禁起来。T-Bag抵达圣地亚哥后，通过鸟类书中的线索发现了一个袋子，里面装有Whistler的假身份证和Gate公司的说明，他随即乘车前往洛杉矶。Roland解密已获取的数据卡后，发现信息并不完整，原来Scylla由6块数据卡组成，分别由不同的人保管，众人的任务尚未完成，必须立即追查其余5块数据卡。此时Michael的鼻子开始流血，这一情况并未被他的兄弟察觉。
第3集
在一个偏僻的地方，愤怒的Michael质问Self，指出他们虽拿到数据卡，但缺少其余5张便毫无意义。Self此前并不知晓Scylla还有其他卡片，却威胁Michael若无法拿到其余5张，仍会将他送回监狱。Michael返回仓库后通知众人必须找到剩余卡片，Mahone悄悄外出致电旧友，要求对方帮忙找出杀害自己儿子的凶手，这段谈话被Lincoln偶然听到，Mahone对此毫不知情。回到芝加哥，Wyatt审问被捆绑的Bennett，他已知晓Bennett保释了Michael和Lincoln，且二人不在监狱中，便对Bennett施加折磨，直至其透露二人的下落。在Self的办公室，他向主管Stanton解释目前需要集齐全部6张Scylla卡，Stanton已失去信心，质疑整个任务或许从一开始就是个错误，Self则坚信Michael能够拿到其余5张，因为Michael此前完成任务的效率远超预期。Michael发现一封发给Tuxhorn、提及抵达伦敦的电子邮件，Mahone认出这封邮件实际是加密信息，破译后得知下午四点将有一场关于Scylla的会议，Roland追踪邮件来源，发现主服务器位于阿纳海姆公司。众人分工，Sucre和Bellick在Tuxhorn的办公室外守候，其余人前往阿纳海姆潜入主服务器。T-Bag在新公寓打开GATE相关文件时，发现一封信，信中提及7.5万美元及今年生效的1万美元奖金。Tuxhorn并未前往办公室，Sucre离开守候地点时，突然被两名武装人员扣留，他悄悄给仓库的伙伴们发送短信示意逃跑，随后缓缓举起双手。全体人员紧急逃离仓库，而Self正通过GPS追踪他们的行踪。逃亡途中，Michael进一步破解了加密信息，明白会议实际于下午四点在纽波特比奇的电厂举行。众人乘坐出租车赶往电厂，Self等人已在此等候，将除Michael外的所有人逮捕，Michael则成功抵达电厂内部，发现Tuxhorn和Pad正在等候其他持卡人。Michael用手机录下所有6名持卡人的影像，将录像发给Self后，Self释放了所有人，众人返回仓库。Wyatt从Bennett口中得知Sara在洛杉矶的消息后，将Bennett杀害。
第4集
由于手机距离较远，仅拍到一个车牌，经查该车牌归属土耳其领事馆人员Erol Tabak。Roland的数据跟踪装置显示，真正的Scylla持卡人并非Erol Tabak领事，而是他的妻子Lisa Tabak。Self致电Sara，告知Bruce Bennett的尸体在其公寓被发现。Michael一行人在公共场所等候Lisa出现，发现她身边有三名私人保镖随行。当Lisa从他们身旁走过时，Lincoln瞥见T-Bag在不远处，便与Michael一同追上并殴打T-Bag，追问鸟类书的下落。此时警察赶来，三人立即撤离。Pad联系Wyatt，命令他前往洛杉矶搜寻Sara的踪迹。Michael向Self说明T-Bag持有一本鸟类书，推测书中记载着Whistler闯入公司的计划。众人返回仓库后研究Lisa的背景，从一份新闻公报中得知她将出席一场名为鹰和天使、纪念殉职警务人员的慈善活动。悲痛的Sara前往酒吧饮酒，向女酒保倾诉自己与Bennett的过往。一名男顾客试图搭讪被她拒绝，随后该男子从Sara的包中偷走Bennett的信用卡后离开。Self前往告密者朋友家中，发现对方已遭杀害，他并未察觉Wyatt刚从这里离开。Michael等人身着警服混入慈善活动现场，Lisa的保安人员认出了Lincoln，Lincoln让Bellick和Sucre开车到后门等候，自己则向后门移动。临近后门时，保安人员拔枪阻拦，Bellick及时出现将刀刺入保安人员腹部。与此同时，Michael和Mahone为拷贝Lisa身上的Scylla卡，设法拖延她离开。Wyatt审问被囚禁虐待的Gretchen，逼迫她透露更多关于Michael和Lincoln的信息，期间他接到电话，得知Bennett的信用卡刚在一家酒吧有消费记录。Wyatt即刻赶往该酒吧，向酒保出示Sara的照片询问是否见过她，而Sara刚在此离开，Wyatt就此错过。Sara在公园散心时接到Michael的电话，Michael邀请她共进晚餐享受二人世界，Wyatt听到了她们的通话，开始跟踪Sara。
第5集
为认出视频中其余的Scylla持卡人，众人需要专家处理视频清晰度，Self却从模糊图片中认出一人名为Oren，此人是财政部洛杉矶办公室负责人，与他在同一栋楼办公。Michael建议Self编造偷窃不明债券事件的理由接近Oren。Mahone与前妻Pam在餐厅会面，向她出示可疑凶手的照片，Pam认出杀害他们儿子的凶手正是Wyatt。Sara发现自己的钱包敞开，Bruce Bennett的信用卡丢失，同时察觉有人跟踪，便立即奔跑设法甩掉Wyatt的追击。在联邦大楼，Self向Oren的秘书出示工作证，声称因美国人生命受到威胁，急需与Oren面谈。Self向Oren说明情况时，Oren让他转过头去，随后打开保险箱，Roland和Michael则同步尝试无线下载保险箱内的数据，不过Oren很快便将Self打发离开。Sara气喘吁吁地跑回仓库，告知众人被一个黑大个子男人跟踪，Mahone拿出Wyatt的照片让她辨认，Sara确认跟踪者就是Wyatt。Mahone坦言Wyatt杀了自己的儿子，且现在想将他们所有人灭口，Sara补充自己此前去过一家酒吧，众人随即着手追查Wyatt的下落。Bellick和Sucre来到Gate公司前台，此时T-Bag刚在这里开启新工作，二人向前台谎称自己来自上谷保险公司，称T-Bag刚获得10万美元遗产，找到他的人可获得10%的酬金。T-Bag在办公室看到前台处的Bellick和Sucre，立刻躲到椅子底下，二人离开后，前台找到T-Bag，称自己能帮他摆平此事但要求分得更多报酬，T-Bag只得同意分给她工资奖金的3%。Self和Michael等人计划潜入联邦大楼，到Oren办公室拷贝保险箱内的Scylla卡数据。Self从停车场将众人送进电梯，还悄悄在Oren办公室门口洒了一些黑色液体，Bellick和Sucre则假扮工程人员负责清理印记，同时制造机器噪音掩护，Lincoln和Michael趁机从通风口进入Oren办公室，开始用电钻破解保险箱。Wyatt回到酒店，给了服务员300元，叮嘱对方若有人来找自己就及时联系，Mahone找到这家酒店时，服务员告知Wyatt已退房，他提出查看Wyatt的房间，走到大厅时恰好碰到服务员给Wyatt打电话，Mahone立即折返用枪指着服务员的头，逼他告知Wyatt无人来找，随后从服务员手中拿到了Wyatt的手机号码。Pad与Oren会面之际，Michael和Lincoln已钻破保险箱，成功下载数据并将物品放回原位后顺利离开。Feng来到T-Bag的办公室索要Scylla，T-Bag称还需要一段时间，Feng威胁他必须在三天内交出，否则就将他杀害。
第6集
Bellick在赛马投注窗口故意制造争吵，经理出面调解，Michael和Mahone趁机偷偷溜进经理办公室，将硬盘机绑在办公桌下。第四名Scylla持卡人是Nathaneal Edison，他下注赌名为SparkleKid的马获胜。Michael按下一个小型仪器，让其他马的闸门比SparkleKid的提前一秒打开，导致SparkleKid落败。Edison愤怒地冲进经理办公室投诉，与此同时，Roland在另一侧开始拷贝Edison身上的Scylla卡数据。Mahone随后溜进办公室准备取回硬盘机，却被当场逮捕并带到警察局，Lincoln立即致电Self寻求帮助。Self在办公室发现一名陌生男子未经通知查看自己的电脑，对方自称是负责检查电脑的IT人员。伤痕累累的Gretchen敲开姐姐Rita的家门，打碎了一个雕像，雕像内藏有几把枪。Rita的女儿实际上是Gretchen的孩子，Gretchen亲吻女儿后便离开了。Gate公司内，T-Bag仍在暗中研究鸟类书中的秘密，同事检查他的销售报告时指控其存在欺诈行为，T-Bag当即逃出公司。此前从Self办公室离开的IT人员向Pad汇报，称无法在短时间内破解Self电脑上的防火墙，因此未查到任何有用信息。Self无法保释Mahone出狱，但签收了他的私人物品并取回了硬盘机，Mahone对此十分愤怒。仓库内的众人想将Mahone从监狱救出，Michael却认为此举过于危险，宣布继续追查剩余的Scylla卡。Wyatt在停车场拦住Self，自称是将军的专属雇佣人员，要求Self提供相关信息，Self予以拒绝，Wyatt则提醒Self将军注重隐私，暗示其后果。Self向Michael提议除掉Mahone以消除潜在危险，与此同时，监狱里的警察向Mahone提出交易，承诺若他供出同伙便放他出狱，Mahone始终沉默不语。Gretchen前往停尸间，谎称是Whistler的遗孀，取走了Whistler的手机，从中获取了一条消息。Wyatt来到警察局，发现Mahone被关押在牢房内，Mahone随即致电Michael，告知Wyatt已发现自己，提醒众人小心，表明自己绝不会供出同伙，但要求Michael保证帮他杀掉Wyatt，Michael至此意识到必须调整计划。Michael和Lincoln埋伏在法院后方的电力变压器旁，Mahone被押往法院准备受审，Sucre悄悄潜入法庭，Wyatt也随之赶到。Sara冒充Mahone的律师，成功索取到Mahone的相关罪证资料。突然，法院的灯光因变压器被破坏而爆炸，现场陷入一片漆黑，Sucre趁机救出Mahone，Wyatt紧追不舍，Sara带着Mahone的罪证资料一同逃离。就在Wyatt准备开枪射杀Mahone时，警察赶到现场，Wyatt只得作罢。众人返回仓库后，Mahone向大家表示感谢，Sara将他的罪证指纹表交给了他。Mahone走到仓库外，拨通了之前记下的Wyatt的手机号码，告知对方自己会复仇，随后挂断电话并扔掉了记有号码的红色小纸片，这张纸片被身后的Roland悄悄拾起。T-Bag在公寓收拾好行李准备逃离，Gretchen突然出现，用枪指着T-Bag的头质问他的身份。
第7集
GRETCHEN在公寓抓住T-Bag，用小刀割伤他的手臂，T-Bag见状表示自己知晓关于Scylla的相关信息。仓库内，Michael等人向Self提出要获取Scuderi身上的Scylla卡，必须前往拉斯维加斯。Self将Mahone叫到一旁，提及自己已被Wyatt发现，询问曾身为特工的Mahone该如何应对，Mahone以自己当年追捕Michael失败的经历为例，建议Self主动出击。Gate公司的前台致电Bellick，称知道T-Bag的下落，但要求支付报酬。众人商议后决定，Michael、Mahone和Bellick留下处理T-Bag相关事宜，其余人前往拉斯维加斯，不料这是个陷阱。T-Bag突然用枪挟持Michael三人，Mahone趁机逃脱，T-Bag则将Michael和Bellick掳回自己的公寓，威胁要杀了Michael，除非Michael帮他解读鸟类书。Mahone从Self处取得GPS跟踪系统前去营救Michael，并告知Self原计划不变。前往拉斯维加斯的众人抵达后，Roland被赌场保安盯上，Sara因迟迟未接到Michael的电话而心生担忧。Lincoln向Sara透露，他们的母亲曾患有脑肿瘤，而Michael在与母亲去世时相同的年纪，也出现了流鼻血的症状。Michael在公寓内悄悄将一张写有Gate字样的鸟类书纸张藏进袋子，询问T-BagGate的含义。T-Bag用枪指着Gate前台美女，逼迫Michael说出鸟类书实则是一张蓝图。躲在另一房间的Gretchen发现Bellick脚上绑有GPS跟踪监视器。Mahone闯入公寓时已空无一人，桌上仅留有两个GPS跟踪监视器，他还发现了一只折叠纸鹤，上面写着Gate。在Gate前台美女家中，Michael拼出了蓝图，前台美女不慎向Bellick透露T-Bag并非单独行动。Michael向T-Bag说明Scylla是公司的黑名单，价值不菲。Pad下令让Wyatt刺杀Self，可Wyatt赶到Self家中时已人去楼空，此时Self已出现在Pad的办公室，他向Pad出示了关于Pad的调查资料，称若自己遭遇谋杀，Pad将是首要嫌疑人。拉斯维加斯这边，Lincoln在赌桌旁坐到Scuderi身边，可Roland的电脑突发故障无法拷贝数据，硬盘机被赌场支出数据占满，众人只得计划约Scuderi单独拷贝。Sucre跟踪Scuderi至游泳池，确认Scylla卡不在其身上，推测可能在房间内。Sara身着比基尼向Scuderi搭讪，试图让他带自己去房间，遭到拒绝后，酒保告知SaraScuderi是同性恋，Sucre被迫接手这项任务。另一边，Gretchen劫持了T-Bag在Gate公司的同事，逼迫对方签下辞职信后将其杀害。T-Bag带着Michael来到Gate公司办公室，进入壁柜后，Michael掀开地毯发现了地下室入口。二人进入地下室后，Mahone及时赶到，将T-Bag关进地下牢房。Sucre来到游泳池，脱下衣服坐在Scuderi身旁，随后Scuderi邀请他前往自己的房间。Sucre内心十分紧张，可Scuderi对他并无兴趣，反而给钱让Sucre与自己的妻子发生关系。众人成功获取数据后准备离开赌场，Roland偷偷留下玩了两把且全部赢钱，却被保安要求离开，并没收了他的硬盘机。Michael向Self和Mahone解读蓝图，称Gate公司地下有一处可破译Scylla的地方。众人离开时，一个垃圾桶下的手机响起，电话那头是Gretchen，她表示自己持有鸟类书的剩余页面，要求用T-Bag进行交换。
第8集
剧情倒叙至2001年的芝加哥，Lincoln与其老伙伴Derrick撞上一辆豪华轿车，抢走了车上公文包内的钱财。回到主线，Michael和Self与Gretchen会面，Gretchen与T-Bag提出要加入团队共同扳倒公司，以此作为提供鸟类书最后几页的交换条件。众人返回仓库后，Michael斥责Roland丢失设备，Sara将Michael拉到一旁询问流鼻血的事情，Michael向她保证自己无碍，并告知她Gretchen尚在人世的消息，Sara震惊不已，巴拿马共和国小单间内遭受酷刑的记忆再度浮现，团队其他人对于Gretchen的加入也反应各异。Roland将自己的手机设置为无法追踪模式，向Wyatt发送短信询问Scofield和Burrows的悬赏金额。Gretchen告知T-Bag必须协助Michael获取Scylla，中国商人Feng找到T-Bag索要Scylla，Gretchen与Feng达成协议，承诺找到Scylla后获得1.25亿美元报酬，并告知T-Bag会分给他2500万美元。公司内部，Pad向其他持卡人说明假币在老挝的流通情况，Wyatt打断谈话，向Pad汇报了收到短信的事情。Self与扣押车处的工作人员闲聊以分散其注意力，协助Michael和Lincoln窃取了一辆救护车，兄弟二人因Lincoln向Sara透露母亲患病的事情发生争执。仓库内，Roland询问Sara，既然脚上的GPS跟踪器已拆除，众人为何不趁机逃跑，还为拉斯维加斯发生的意外致歉。Gretchen致电Self，希望他帮忙转达与Sara见面的意愿，遭到Sara拒绝。Roland收到Wyatt的回复，对方承诺支付100万美元，要求他当天告知Michael和Lincoln的下落，Roland随即泄露了众人所在的街道位置。Michael和Sara在救护车内等候，Lincoln和Sucre则埋伏在一旁，等待Pad驾车驶出后伺机撞击，与此同时Wyatt也致电Pad通风报信。Pad的豪华轿车驶出后，正当Lincoln等人准备实施撞击时，轿车突然180度调头，众人才察觉落入陷阱，Wyatt现身开枪射击，Sucre中弹受伤。众人返回仓库后，Sara紧急抢救Sucre，他们始终无法理解Pad为何会知晓埋伏地点，Michael质问Roland，Roland予以否认。Self向Gretchen和T-Bag提供豁免权，但警告二人任务完成后必须立即离开美国。前台Trishanne诱骗GRETCHEN留下指纹交给T-Bag，T-Bag则谎称双方协议的报酬为100万美元。Self致电Michael询问Roland的下落，称其GPS信号已离线，Michael发现Roland脚上的GPS跟踪器已被切断，存有5张卡数据的笔记本也不翼而飞。抢救Sucre的过程中，Sara再次回想起被Gretchen酷刑折磨的巴拿马共和国往事，她情绪激动地前往汽车旅馆见到Gretchen，Gretchen递给她一根鞭子，脱去上衣背对着她，给她5分钟时间进行报复。Sara看到Gretchen背后的疤痕，持刀抵在她的脖子上，要求她说出巴拿马时期那个看守的名字，那个看守曾救过Sara，后来却被Gretchen杀害。Sara最终没有鞭打Gretchen，但明确表示会为那个看守讨回公道。Roland前往与Wyatt约定的地点，却发现Wyatt并未携带赏金，Wyatt开枪击中Roland的膝盖，逼问Michael和Lincoln的下落，Roland被迫说出仓库地址，随后被Wyatt射杀。就在此时Mahone现身殴打Wyatt，Lincoln和Michael及时拉开Mahone，Michael打开了Roland的笔记本，原来他此前已在电脑中植入跟踪装置，才得以找到Roland的位置。Pad下令让其他持卡人转移Scylla卡。
第9集
Lincoln痛殴Wyatt，逼迫他打电话告知将军众人已死，Wyatt始终拒不屈服。Self携带一个手提箱来到仓库，与其他队员研究由鸟类书拼凑而成的蓝图，却发现仍缺少Gretchen手中的最后几页才能完整。Pad将军急于转移Scylla，Lisa却告知他至少需要三天时间，Pad随即命令各媒体刊登Michael等人的犯罪资料，让他们无法在大街上自由行动。T-Bag带领Michael、Lincoln、Sucre和Bellick来到Gate公司办公室的储物间，T-Bag的老板向他提及同事失踪的事情，T-Bag致电Gretchen确认尸体已妥善埋藏，不久后一名侦探前来询问该同事失踪的相关情况。Wyatt的手机不断响起，他试图说服Sara，提出一个能解决问题且让所有人受益的方案，声称可以帮助她和Michael逃跑。此时Mahone怒不可遏地向Wyatt走去，Self立即制止了他，承诺最后一定会让他处置Wyatt，让他先忍耐。Michael、Lincoln、Sucre和Bellick发现了洛杉矶供水主渠道，开始在渠道边挖掘，却发现下方并非水泥而是花岗石，无法挖动。Michael随即提议从供水主渠道穿行，之后他和Sucre在附近拆卸一根长钢管，Lincoln和Bellick则去破坏供水系统。Self的手提箱实则是一个音频记录装置，他利用其制作出Wyatt的声音录音，内容为他们都死了，结束了。他带着Sara离开仓库，让Mahone看管Wyatt，还拿走Wyatt的手机致电Pad将军，播放了这段录音，Pad将军对此十分满意。与此同时，Gretchen突然举枪闯入Pad将军的办公室，Pad向她解释自己是想告知她关于Whistler的Scylla计划，在不断称呼她我的女孩并亲吻她后，Gretchen放下了枪。Michael和Sucre听到水流停止的声音，Michael突然头部剧痛倒坐在地，只能让Sucre独自继续作业。Mahone从之前盗取的救护车里取出心脏监视器，用它持续折磨Wyatt，逼迫Wyatt打电话向妻子道歉。T-Bag让前台Trishanne偷来自己以前的销售报表，随后将报表交给老板，谎称这是失踪同事的，并指出报表中的错误，证明该同事一直在说谎，还建议老板向侦探撤销侦查。Sucre在供水主渠道上切割出一个大圆洞，只需在对面切割相同大小的洞即可，可此时工具没了火源，Michael不得不前去帮忙，两人一同用锤子敲击破壁。此时Michael已开始眼花，Lincoln和Bellick返回后，众人一起将钢管从洞中插入。Pad将军向Gretchen详述了Scylla的计划，希望她留在自己身边，Lisa汇报Scylla将于次日转移完毕，Pad表示转移完成后立即离开洛杉矶，Gretchen听到他说Michael和Lincoln已死的消息后十分震惊。Mahone将Wyatt带到河边，Wyatt双手被捆着重石头，话未说完便被Mahone推入河中。Michael等人即将把钢管插入第二个洞口时，钢管的支撑柱突然断裂，而供水系统即将恢复，危急时刻Bellick跳入供水主渠道充当人肉支撑柱，在水流涌来之前成功协助众人将钢管接通，自己却不幸牺牲。
第10集
Bellick牺牲后，众人悲愤交加，强烈要求Self将Bellick的遗体送回其母亲身边。Gretchen最终交出鸟类书剩余页面，并告知众人公司正准备转移Scylla。与此同时，Lisa向Pad将军汇报，Scylla转移遇到问题无法按期完成，需推迟时间。Michael将剩余的鸟类书页面拼接完整，发现上面有一个名字David Baker，Sara通过网络搜索得知此人是一名城市规划师。突然Michael倒地不起，Sara立即开车送他前往医院。前台Trishanne交给T-Bag一份Gretchen的档案资料，却不慎提及Whistler的名字，这引起了T-Bag的怀疑与警惕。他向老板询问Trishanne的情况，得知自己来公司之前，Trishanne只是临时雇员。随后Gretchen来到T-Bag办公室，告知他Scylla转移的相关事宜，此时Lincoln和Sucre也赶到了办公室。Mahone前往David Baker的住所，谎称自己来自公司，David Baker向他透露Scylla能够创建一个新的社会，随后察觉Mahone并非公司人员。Mahone恳求David Baker提供帮助，公司的人却在此刻抵达，Mahone只得匆忙逃离，David Baker被当场抓捕。David Baker的妻子找到Mahone，交给了他一张标注着鸟类书中字母含义的纸条。Mahone带着纸条返回仓库，Michael看过之后立即意识到，Sucre脚下的地雷不仅是爆炸装置，还是一个报警装置，但他想到了解决办法。另一边，Gretchen正在手动拆除Sucre脚下的地雷，Mahone及时赶到制止了她，他在墙边找到一个开关并关闭，Sucre起初不信问题已解决，迟迟不敢挪动脚步，最终移开脚后，众人安然无恙。Self带着Bellick的遗体前来与众人告别，Sucre致电Bellick的母亲，告知了她Bellick牺牲的噩耗。T-Bag找到Trishanne的求职申请，拨打了上面的联系电话，电话那头却传来了Self的声音。Michael正在研究新的计划，准备获取地下防守严密的Scylla，此时Sara接到医院的电话，得知Michael的肿瘤正在增大，必须在第二天立即手术，否则很可能有生命危险。
第11集
Sucre在Scylla外部的墙上钻了一个小洞，放入摄像头，Mahone将其与笔记本电脑连接，通过画面发现内部设有加固钢铁墙、音频传感器和温度传感器。Sara劝说Michael当天接受手术，Michael不愿在关键时刻离开，几经劝说后勉强同意，Sara向他讲解医疗流程，说明医生会在他的脑壳上钻几个洞进行治疗。T-Bag协助Gretchen拍摄了色诱照片，并添加邀请文字发送给Pad将军，试图通过美人计获取最后一张Scylla卡。Pad将军应邀前来，却直接告知Gretchen自己并未带卡，还警告她若再出现就将其杀害。T-Bag故意向Trishanne调情，提出只要她脱掉外套就付钱，遭到Trishanne拒绝。T-Bag由此更加确定她是联邦特工，因为对方不肯脱外套，大概率是身上携带了枪支。此时Gate公司老板递给T-Bag一张当日出发、为期一周的旅游券，被T-Bag拒绝。T-Bag将Trishanne的特工身份告知Gretchen，Gretchen随即致电Feng寻求帮助。Self告知Michael，Gretchen未能拿到第六张Scylla卡，与此同时Trishanne致电Self，告知购买Scylla的人已抵达Gate公司。Michael最终没有前往医院，他担心自己离开后其他人被抓，而自己因手术独活，Sara无奈之下给他注射了一针药物，以防他接下来几小时内被抓获。Pad将军向Lisa表示感谢，称Lisa提醒他Gretchen企图偷卡是正确的，并要求Scylla立即转移。Trishanne偷听到T-Bag与Gretchen的通话，得知还有另一位买家对Scylla感兴趣，便立即将这一消息告知Self。Scylla墙外，Michael等人已开始行动，他们尽量不发出噪音，成功在墙上破出一个洞。Sucre着手搭建洞口与Scylla之间的通道，并打开一瓶气体以维持房间温度，过程中气瓶不慎滑落，Sucre及时抓住才避免其落地，自己却悬在半空中，Lincoln爬过去将他拉了上来。Self和Trishanne准备突袭T-Bag与Gretchen通话中提及的买方约定地点，不料Feng早已在此埋伏，将二人捆绑控制。Gretchen和T-Bag返回Gate公司，在T-Bag办公室门口等候Michael取出Scylla，计划伺机抢夺，T-Bag还要求Gretchen将Michael留给自己处置。Lisa向Pad将军汇报已做好Scylla转移准备，这一幕被Sara看到。通道搭建完成后，Michael走向Scylla，来到玻璃墙前，用工具在玻璃墙上划开一个大洞并爬了进去。当他试图取下Scylla时，Pad将军的办公室收到警报，Pad将军打开监视器，正好看到了Michael。
第12集
Michael正在研究Scylla的开启方式，尽管集齐了6张卡，但Scylla上仅有一个卡口。此时Pad将军带着两名手下出现，埋伏在一旁的众人随即上前将他们控制，从Pad将军身上搜出了最后一张Scylla卡。另一边，Self悄悄解开脚镣手铐，Trishanne则杀死了Feng。Gate公司内，T-Bag和Gretchen已各持一把枪，等候Michael出来。Trishanne返回公司后，发现所有员工都已被挟持为人质，她偷偷溜进去试图释放人质，却发现老板已经死亡，最终成功抓住了T-Bag。Michael等人挟持Pad将军来到他的办公室，此时公司已启动红色警报，全面封锁关闭。Sara趁Lisa进入洗手间时，用枪将其抓获。Pad将军试图说服Michael等人留下Scylla，承诺会给予他们自由和金钱，Michael则拿出手机，Pad将军从中听到了Lisa的声音，才得知Lisa是自己的女儿，无奈之下只得放走众人。Michael带领大家抵达机场后兵分两路，Pad将军的手下紧随而至，跟着Michael进入机场，并要求机场取消所有航班。Michael立即发短信通知另一路的Mahone，Mahone等人随即拨打911，称在机场发现可疑背包。当Pad将军的手下抢走Michael的背包时，警方赶到将其带走检查，而背包里只有一本书，Scylla实则在Mahone等人身上。众人返回仓库后，Michael将Scylla交给Self，Self向他们表示祝贺，称他们已经获得自由，稍后会有车子来接他们，还递给他们档案转移文件。一小时后，接人的车子迟迟未到，Michael拨打Self的手机，却提示号码不存在。他打开那个黄色的转移文件袋，发现里面只有几张白纸。另一边，Self询问Trishanne是否还有其他买家愿意购买Scylla，Trishanne表示Feng已死，可能还有其他买家，而T-Bag大概率知晓相关情况。随后Self杀害了Trishanne，这一幕恰好被T-Bag看到。
第13集
成交不成交（Deal Or No Deal）原来Self耍了所有人，他利用国家安全局的身份驱使Michael和Lincoln等人为自己卖命，目的只是获取Scylla后高价出售，众人无奈之下只得继续逃亡。为寻找Scylla的买家，Self囚禁了Gretchen的女儿。在与买家交易时，Self发现Scylla缺失了一小部分，殊不知这部分早已被Michael偷偷藏了起来。
第14集
交易（Just Business）Self四处寻找Scylla丢失的部分，T-Bag负责看守Gretchen的女儿和妹妹，却被一名伪装成杀手的公司人员擒获，不过他放走了Gretchen的女儿和妹妹。Michael从Self手中夺回Scylla，但逃亡途中他脑瘤病发，最终被公司抓获，Scylla也再次被Self偷走。为营救Michael，Lincoln同意加入公司并找回Scylla。
第15集
手术进行（Going Under）在公司的胁迫下，Lincoln与Sucre等人合作寻找Scylla。交易过程中，卖家打伤Self并抢走Scylla，Lincoln与Sucre擒获了Gretchen和Self。公司派遣医生为Michael进行脑部手术，昏迷期间DB Cooper的身影出现在他眼前，Michael由此悟出Scylla的真实价值。手术顺利完成，Michael醒来后告诉Sara，Scylla是一套先进完善的太阳能利用装置。Michael随后得知Lincoln加入公司的消息，还发现自己的母亲原本也是公司成员。
第16集
阳光之州（The Sunshine State）Lincoln、Gretchen、Self和T-Bag前往迈阿密寻找Scylla，随后Mahone也加入队伍。Gretchen发现买家是公司成员，且该成员已背叛公司。在与卖家的激战中，Gretchen中枪，被众人遗留在现场等待警察处理。此时Michael已被公司囚禁并洗脑，公司希望他能为己所用。Michael还得知自己的母亲Christina尚在人世，且一直为公司工作。Lincoln与获得Scylla的人取得电话联系，他并未察觉对方正是自己的母亲。
第17集
母亲的秘密（The Mother Lode）Michael逃出公司的囚禁，与Sara冒险前往迈阿密。Christina与Lincoln相见，告知他自己计划搞垮公司。T-Bag和Self追踪Scylla来到一间教堂，并有意外收获。此时Michael和Lincoln因观点不同产生了分歧。
第18集
神秘教授（VS.）在T-Bag、Mahone等人的提醒下，Lincoln发现Christina另有阴谋，她甚至下令在广场狙击Lincoln。Christina拜访印度大使馆，希望将Scylla卖给印度首相之子。Michael发现Christina在等待一位简称VS的人，便从机场劫走了这位教授。此时Sara发现自己怀孕，却没有告知任何人。
第19集
母子重逢（S.O.B）Michael囚禁了自己的母亲Christina，希望获取更多信息，Christina却告知他Lincoln并非他的亲生兄弟。T-Bag向公司泄露了众人的秘密，企图在将军面前谋取一席之地。将军从教授口中逼问出了Christina的秘密。印度首相之子出席高科技展会时，遭到枪杀。
第20集
牛仔和印度人（Cowboys & Indians）原来Christina的真正目的是利用印度首相之子被害的事件挑起中印两国争端，再将Scylla分别卖给两国。混乱中，Michael和Lincoln被困在展会内，Lincoln发现自己被Christina陷害。Michael成功夺回Scylla，然而将军抓走了Sara，Christina抓走了Lincoln，他再次面临两难的威胁。Don Self、T-Bag与猫女终于在一家纹身馆门前找到Michael，Michael被人用枪指着头，被迫带他们去取Scylla。Michael设计脱身，却被意外情况缠住，危急时刻Mahone出现，牵制住Don Self等人，让Michael趁机逃跑。与两伙人的交易期限日益临近，Lincoln焦急万分，此时突然接到Michael的电话。
第21集
Michael救出了Sara，Mahone假意背叛Michael，与Michael的母亲进行交易，条件是救出自己的妻子并释放Lincoln。Michael的母亲被伪装成锡拉的炸弹炸晕，Mahone趁机带着Lincoln逃脱。众人简单救治受伤人员后便撤离。将军被设计抓获，Michael的母亲通过追踪Lincoln的手机找到众人并夺走锡拉，Michael欲射杀母亲时子弹卡壳，危急关头Sara开枪打死了Michael的母亲。Kellemen帮助众人洗清罪名。多年后，众人来到Michael的墓前祭拜，原来他旧病复发最终牺牲。
第22集
最后一越（Prison Break: The Final Break）Sara因射杀Michael的母亲被起诉入狱，Michael决定帮助Sara越狱。他制定计划，打算从监狱的供电房逃脱，然而最后电闸出现故障。两人吻别后，Michael告诉Sara自己时日无多，能救她便值得了，随后为让Sara顺利开门逃走，他牺牲自己拉开电闸。一阵火花过后，Sara从地下供电房逃出，Lincoln等人见状立即询问Michael的情况，Sara望着供电房出神，众人已然知晓结果。之后Lincoln带着Sara前往墨西哥，Sara为Michael生下一个孩子，过上安逸的生活，而Michael则留存下永恒的梦想与憧憬。多年后，便迎来越狱第四季的大结局，被Michael救赎的众人来到他的墓碑前亲吻墓碑，缅怀这段越狱传奇。
以上剧情参考资料
第五季
第1集
茶包哥刑满出狱，领取个人物品时发现一封境外寄来的神秘邮件，信封带有雄鹰标记。拆开邮件后，他神色大变赶往芝加哥寻找亚伯拉罕·林肯。林肯自弟弟迈克尔死后重回社会底层，被讨债人追讨，见到茶包哥送来的邮件十分震惊。邮件内是一张模糊的黑白照片，脸型酷似已过世七年的迈克尔，纸下端有一行神秘文字。林肯将茶包哥打发走后，决定前往纽约州找莎拉商议。茶包哥离开林肯家后，收到义肢研究中心主任惠特库姆医生的预约。赴约后得知，有人以希腊语意为没人的乌提斯之名匿名捐款资助义肢项目，条件是让茶包哥成为第一名义肢接受人，茶包哥联想到邮件内容，虽感不安仍决定接受。亚伯拉罕·林肯抵达纽约州途中察觉被红色跑车和黑色皮卡先后跟踪，确认安全后才抵达莎拉家。莎拉已重组家庭，面对照片难以判断，因专注家庭不愿深究，林肯也认可可能是茶包哥的恶作剧。林肯来到迈克尔墓前，意外发现纸上文字经擦拭后残留字母拼成奥杰吉亚。奥杰吉亚是也门的一所监狱，林肯深夜掘墓，发现棺材内只有衣服，迈克尔遗体不翼而飞。次日林肯驾车返回芝加哥，等红灯时被机场见过的男子驾驶红色跑车逼近，车辆突发故障失控坠潭，林肯侥幸逃生，藏起后用公用电话向莎拉示警。莎拉发现家门口有黑色皮卡及持枪女子，立即安排家人避险，雅各布中枪倒地，女杀手在警车赶到前逃离，莎拉随即呼叫救护车。亚伯拉罕·林肯在医院见到莎拉和受惊的麦克，深感内疚，决定只身前往也门奥杰吉亚监狱寻找迈克尔。林肯找到迈克尔的好友，清真寺的阿訇布鲁斯寻求帮助，布鲁斯告知奥杰吉亚监狱关押的都是重要人物，且也门政局动荡，营救难度极大。照片背景与谷歌地图上奥杰吉亚监狱外的清真寺吻合，布鲁斯联系监狱方未查到迈克尔，林肯发现迈克尔的相关记录均被篡改，更坚定前往也门的决心。出发前，林肯带上迈克尔的衣服，婉拒了苏克雷的帮助，布鲁斯最终决定陪同前往。二人抵达也门海关，逆着难民人流与布鲁斯联系的接应人希巴碰面，刚出机场便被冒充司机的人带入陷阱，一番激战后成功脱身。希巴将二人带到安全区，约定以亚伯拉罕·林肯的护照为报酬安排探监。进入监狱后，看守认出照片上的人名为卡尼尔·乌提斯，希巴得知此人是恐怖分子后翻脸，林肯却凭借迈克尔衣服后领的商标确认卡尼尔·乌提斯就是迈克尔。监狱门打开，迈克尔走到铁栅栏前，露出掌上的眼睛纹身，却否认自己的身份，简短交谈后便返回监室，林肯痛苦跪地呼喊。
第2集
恐怖组织ISIL逼近也门城市中心，目标是接管国家并解救被关押在奥杰吉亚监狱的领导人阿布·拉马尔。监狱内，迈克尔趁看守巡查过后，从囚友维普手中接过小扳手，拧开天花板铁栅钻进通风管道。维普因性取向不符合当地法律被判二十年徒刑，迈克尔曾与维普的父亲约定切断全城电源，以便二人趁黑越狱，然而连续七天都未等到电源切断，ISIL逼近，迈克尔决定向亚伯拉罕·林肯求助。林肯和布鲁斯在也门旅馆将拍摄的迈克尔视频发给莎拉，讨论之际发现有人偷听，追出去后失去踪影，返回旅馆时发现门前踏脚垫上有一只纸天鹅。纸天鹅是迈克尔的标志，里面写着找到光之酋长即可重获自由，林肯信心大增，决定找希巴帮忙。二人来到希巴家，得知希巴正劝父亲离开也门，因家庭为政府工作恐遭ISIL清洗，却无力承担费用。希巴起初拒绝帮助，在林肯的美元诱惑下改变主意。希巴发现纸条下的针孔是电话号码，拨打后转入政府电机工程学部主任穆罕默德的语音信箱，三人前往电气工程部，得知穆罕默德一周前前往郊区接女儿后失联，而郊区已被ISIL占领。为获取报酬帮助父亲离开，希巴决定带亚伯拉罕·林肯和布鲁斯前往郊区寻找穆罕默德。三人通过政府军哨卡，沿途一片废墟，途中遭遇ISIL检查站，负责人是希巴的旧识雷扎，恰逢政府军展开攻势，三人才得以顺利通过。抵达穆罕默德女儿家，发现有ISIL士兵把守，三人从房顶进入屋内，与穆罕默德发生误会，解释清楚后得知穆罕默德因女儿和几名女学生被关在对面学校而不愿离开。林肯制定营救计划，布鲁斯和希巴护送穆罕默德返回车上，自己则打倒皮卡司机救出被困人员，两辆车汇合后遭到ISIL追击，最终在政府军哨站的帮助下摆脱追兵。穆罕默德与女儿重逢，希巴对亚伯拉罕·林肯心生好感，接下来只需等待穆罕默德切断城市电源。与此同时，莎拉收到林肯发来的视频后向国务院求助，接待她的是凯勒曼，凯勒曼告知卡尼尔·乌提斯是涉嫌谋杀中情局高级官员的通缉恐怖分子，通缉令上的照片正是迈克尔，推测是迈克尔自行策划了这一切，莎拉对此表示不信，转身离开。凯勒曼向莎拉邮箱发送了官方视频证据，视频中显示迈克尔开枪射杀一名男子并转移尸体，中情局曾在也门机场险些抓获他，从其托运行李中提取到被害者血迹，证据确凿后发出国际通缉令。莎拉心情复杂，向病床上的丈夫雅各布寻求意见，雅各布分析迈克尔精于算计，可能为达目的不择手段，自导自演了这出戏。莎拉接麦克放学时发现麦克不在教学楼，四处寻找后发现麦克平安无事，但麦克手中的纸玫瑰里有迈克尔的笔迹，写着众生皆隐藏，风暴即将至。监狱内，迈克尔为实施备用方案，向囚友雅索要手机。雅是技术高超的黑客，也是皇后乐队的狂热粉丝，在囚室藏有手机。迈克尔假装高烧求助，遭看守殴打后得到两颗仿Morphine药片，用药片从雅手中换得手机。当晚监狱灯光闪了两下，这是约定的24小时后切断电源的信号，但迈克尔已没有足够时间，当天是斋月开始，狱方将阿布·拉马尔及其手下放出与其他穆斯林一同祈祷，维普和迈克尔的性命岌岌可危。阿布·拉马尔被手下簇拥着走向迈克尔，众人以为迈克尔会被处决，不料阿布·拉马尔热情与迈克尔拥抱，还低声询问逃走时间，迈克尔回应就在明晚。
第3集
炮火逼近，也门首都大部分地区落入ISIL之手，迈克尔需通知亚伯拉罕·林肯到指定地点汇合。他按手臂纹身画出一段古兰经文字，折成飞机夹进口香糖，从铁窗缝隙飞出。墙外小孩捡到后送往旅馆，林肯抓住小孩并承诺给予更多糖果，打开纸飞机，希巴认出经文字体特殊，布鲁斯对比地图后认为这是也门首都中心地带的地图，文字中的红点是汇合地点。希巴本不愿继续参与，林肯承诺救出迈克尔后出资为维普的妹妹和想读书的女孩购买机票，希巴才改变主意。地图上的红点是一家已停业的汽修店，店内留下了迈克尔的越狱路线和几张照片模板，包括迈克尔和阿布·拉马尔的照片，众人越发困惑。为离开也门，希巴再次找人办理假护照，约定晚上十一点取件。距离断电还有九小时，炮声逼近，维普情绪失控。四年前维普受迈克尔招募为代号波塞冬的人办事，此次入狱是为救出阿布·拉马尔，ISIL占领监狱部分区域后，阿布·拉马尔及其手下开始推行伊斯兰教法，处决异教徒和同性恋，维普险些被吊死，迈克尔公开反对阿布·拉马尔的决定，典狱长朝天开枪才平息事态。维普因他人挑拨对迈克尔产生怀疑，二人发生争执。迈克尔注意到典狱长的金表，故意与维普发生肢体冲突，趁典狱长拉架时将金表塞进自己口袋。纽约医院内，一对男女讨论着莎拉得到迈克尔消息的事，他们正是此前追杀林肯和闯入莎拉家的杀手，二人此次前来是为通过医院免费wifi入侵莎拉的手机。莎拉对危险毫无察觉，雅各布伤势痊愈即将出院，莎拉计划带家人前往雅各布父母的湖畔小屋。从病房出来走进公共卫生间时，茶包哥突然出现，告知莎拉有人以乌提斯之名出资为自己安装机械手掌，查询乌提斯时发现了迈克尔的照片，希望与莎拉合作查明真相，莎拉拒绝并迅速离开。莎拉来到走廊准备联系林肯，发现手机被入侵，随即前往手机店购买新手机，并将旧手机交给店主检查。十分钟后，追杀莎拉的男女来到手机店询问，莎拉在街对面服装店看到后从后门逃跑，被二人追击至屋顶，莎拉躲进通风管道，听到女杀手抱怨波塞冬应直接干掉自己。莎拉回到医院办理出院手续，带家人前往湖畔小屋，途中接到手机店长电话，得知入侵手机的人匹配的是自己的指纹，莎拉怀疑是凯勒曼所为，决定与茶包哥合作，让其出面与凯勒曼交涉。晚上十一点，希巴和亚伯拉罕·林肯前往约定地点取假护照，布鲁斯和穆罕默德则前往发电厂切断电源。林肯支付余款后发现护照空白，雷扎突然冲出抓住希巴，其他人将林肯打晕。林肯醒来后听到希巴呼救，撞开房门打倒雷扎，搀扶希巴离开。监狱内灯火通明，典狱长发现金表失窃，怀疑迈克尔，搜查无果后下令全面搜查，最终在阿布·拉马尔手下口袋里找到金表，阿布·拉马尔察觉被迈克尔欺骗。此时灯光突然熄灭，监狱陷入黑暗，阿布·拉马尔下令手下袭击狱卒并前往迈克尔囚室。迈克尔原本受命救出阿布·拉马尔，因遭欺骗改变主意，计划带维普、雅和希德一同越狱，却因典狱长增派人手、希德未能进入通风管道、阿布·拉马尔引来更多狱卒而失败。布鲁斯在墙外看到迈克尔高举双手从天台走过，知晓越狱失败。禁闭室内，迈克尔听到阿布·拉马尔的复仇誓言，自知无生还希望，用雅的手机录下对莎拉的遗言，表明一切都是为了莎拉，只要自己死亡，莎拉就能安全，流着泪想对莎拉说我爱你，却不知莎拉能否听到。
第4集
茶包哥应莎拉所求，潜入凯勒曼的公寓，询问其与迈克尔的关系，得知凯勒曼并非波塞冬。凯勒曼介绍，波塞冬不属于任何部门，行事诡异，为达目的不择手段，可能会帮助阿布·拉马尔越狱以削弱俄罗斯在中东的影响力。交谈间，两名杀手突然闯入，凯勒曼中枪倒地，茶包哥从地下室气窗逃生，随后偷偷跟踪杀手，拍到与杀手联络的人竟是莎拉的丈夫雅各布。此时也门萨那陷入混乱，一小时后ISIL将全面占领该地区。穆罕默德用自己的宝马车换来一张特赦令，与亚伯拉罕·林肯前往监狱，却发现狱卒已全部逃离，典狱长也已逃命，特赦令失效。要放出囚犯需典狱长手中的钥匙，林肯追踪典狱长，亲眼目睹其被恐怖分子击毙，一时无法从恐怖分子手中获取钥匙。监狱禁闭室内，迈克尔并未放弃，他曾被关在此四年，期间编制了麻绳并偷藏了一把不锈钢调羹作为越狱工具，只是当时未找到合作对象，便将工具藏进墙壁，而阿布·拉马尔恰好被关在藏有工具的禁闭室。此时，监狱内的囚犯为求自保，打算用阿布·拉马尔的性命与ISIL谈判，阿布·拉马尔无奈之下只能与迈克尔合作。囚犯们疯狂砸隔离区铁门，试图进入禁闭区抓住阿布·拉马尔，阿布·拉马尔在迈克尔的指挥下，用调羹、水管和麻绳制作撬棍，撬开了迈克尔禁闭室的铰链。迈克尔推开铁门，从看守室拿到钥匙，打开维普、雅和阿布·拉马尔的禁闭室门，在其他囚犯冲进来前，几人逃进医务室。阿布·拉马尔打电话安排手下到汽修店接应，迈克尔趁机撕下地图一角塞给雅。在希德的帮助下，几人摆脱追兵，翻越高墙逃离监狱，未听到高墙下亚伯拉罕·林肯的呼喊。林肯通过送信小孩引开恐怖分子拿到钥匙，赶到时已错过迈克尔。迈克尔不信任阿布·拉马尔，故意赶走雅，带领阿布·拉马尔绕远路前往汽修店，雅提前赶到汽修店寻找桌下手枪。迈克尔本想挟持阿布·拉马尔直至安全离开也门，却不料阿布·拉马尔的手下早已控制汽修店，雅未能拿到手枪。林肯赶到时，正看到迈克尔等人被恐怖分子包围，阿布·拉马尔持刀抵在迈克尔脖子上。林肯跳上皮卡车，打倒枪手夺过重机枪，双方陷入对峙。维普趁机靠近阿布·拉马尔，反手将刀捅进其胸口，亚伯拉罕·林肯开枪镇住其他恐怖分子，众人匆忙逃离汽修店。几人躲进一家废弃咖啡店，林肯和迈克尔终于得以拥抱，然而ISIL已占领电视台，向杀死阿布·拉马尔的人宣战。
第5集
莎拉给丈夫打完电话后，茶包哥突然出现，向其展示了雅各布与两名杀手见面的照片，莎拉惶恐不已，担心儿子麦克的安危，立即驱车返回湖边小屋接儿子，在门口遇到雅各布。面对莎拉的怀疑，雅各布解释是找精通电脑的朋友分析手机后，追踪到杀手电话，想联系对方彻底解决问题，莎拉心慌意乱，带着儿子匆匆离去。抵达好友海瑟家后，莎拉逐渐平静，海瑟不相信雅各布是间谍，帮助莎拉找到雅各布所说的朋友，确认雅各布确实是想提供帮助。莎拉疑窦稍减，接通雅各布的电话，雅各布请她尽快到警局，莎拉赶到后发现两名杀手已被抓获，需要进行指认，至此莎拉终于相信雅各布，为自己之前的行为感到自责。与此同时，也门国际机场一片混乱，ISIL军队逼近，所有登机口关闭，布鲁斯、希巴、穆罕默德及其女儿和几名孩子均未能登机。布鲁斯四处寻找帮助，发现一名飞行员正向员工通道跑去，便带着众人跟了上去。飞行员本有办法逃走，却被两名恐怖分子拦住盘问，幸得希巴和布鲁斯出手相助才得以脱险，飞行员为表感谢，答应乘坐机库内的老式双螺旋桨飞机带众人离开。布鲁斯希望等待迈克尔和亚伯拉罕·林肯，然而也门已全面落入ISIL之手，ISIL在全国范围内重金悬赏杀死阿布·拉马尔的西方人的人头，雷扎因曾被林肯教训，决心借机报复。迈克尔和林肯等人看到悬赏公告，只能离开街道寻找躲避之处。在一个地下室里，林肯向迈克尔追问装死不联系家人的原因，迈克尔解释，在与莎拉结婚前几周，中情局探员波塞冬找到他，波塞冬组建了秘密的21真空组织，要求迈克尔为其在世界各地协助越狱，交换条件是保障其家人安全并获得赦免。迈克尔最初拒绝，导致莎拉因谋杀罪入狱遭受折磨，无奈之下只能屈从，伪造死亡假象，与家人断绝联系，亚伯拉罕·林肯听完后沉默不语。此处距离机场不远，但迈克尔直觉机场不安全，提议从车站乘火车前往也门北部离境，维普、希德和雅均听从迈克尔的安排，林肯只能同行。几人在城北车站乔装搬运工时暴露，打倒ISIL士兵后逃离，驱车前往另一个车站时，被雷扎暗中跟踪。雷扎带领恐怖分子围追堵截，迈克尔等人弃车逃进路边医院。医院内空无一人，迈克尔四处寻找出口无果，心生绝望。雅此时展现出黑客的高智商，将氧气瓶塞进人体骨骼标本，披上白大褂，周围洒上高浓度医用酒精。恐怖分子进入搜查时，在昏暗光线下误判目标并开枪扫射，子弹击中氧气瓶引发爆炸，迈克尔等人趁机逃出医院，却遭到雷扎的黑枪袭击，希德受重伤，临死前死死抱住雷扎，为迈克尔等人争取了逃生时间。迈克尔不再坚持乘火车的想法，与众人向机场奔去，却为时已晚，ISIL军队正从跑道另一头挺进。飞行员不顾布鲁斯阻拦，发动引擎冲出机库，抢在恐怖分子抵达前升空。亚伯拉罕·林肯在机场铁丝网外看到险情，打电话让布鲁斯等人尽快起飞，希巴冲进驾驶舱想告知林肯去找制作假护照的奥玛，却因飞机轰鸣声盖过声音，林肯未能听清。迈克尔和林肯只能依靠自己，逃离这个战乱的国度。
第6集
纽约惠特尼海兹警局，曾是国家安全局无人机操作员的艾米丽坐在拘留室里，她因目睹中东地区的惨状，加入波塞冬的21真空组织试图改变世界。波塞冬很快保释了艾米丽和她的男搭档，随后艾米丽接到接替凯勒曼职务的岸田探员的电话，对方询问迈克尔的情况并要求见面，艾米丽挂断电话后未予重视，专注于完成波塞冬安排的除掉卡尼尔·乌提斯的任务。艾米丽来到国家安全局，在老朋友的破例允许下，与搭档进入战术室观看追踪卡尼尔·乌提斯的行动。此时，迈克尔等人躲在一幢废墟中，亚伯拉罕·林肯记得希巴在电话里提到去找奥玛，便找到准备逃离也门的护照商人奥玛。奥玛计划穿越四百多公里沙漠前往费阿刻斯，那里的朋友能提供船只，他提出迈克尔等人若想同行，需到两个街区外的停车场找回另一辆丰田汽车车作为报酬，迈克尔只能同意。迈克尔留下维普看管奥玛，与林肯、雅一同寻找丰田车，找到车辆时陷入ISIL的埋伏，一番激战后方才逃脱。返回奥玛家时，发现维普被反绑在树桩上，因只有奥玛知晓前往费阿刻斯的路线，众人只能放弃追究，即刻出发。途中，亚伯拉罕·林肯接到布鲁斯的电话，得知希巴等人已抵达约旦，正在等候前往美国的飞机，这个电话被国家安全局监听，成功定位林肯的方位，无人机随即展开高空侦察。艾米丽示意搭档向ISIL现任负责人通报迈克尔的下落。迈克尔等人的车在加油站停留时，遭到ISIL袭击，奥玛受伤倒地，维普开枪击中追兵身边的油罐车，借助爆炸掩护众人脱险，这一过程被无人机全程记录，艾米丽和搭档发现迈克尔当时在与某人视频通话，截取的图片显示迈克尔双手张开坐在屏幕前，二人对其手掌上眼睛纹身的深意感到困惑，通过IP追踪到视频通话的另一方是一位打扮成埃尔维斯·皮礼士利的豪宅主人。摆脱追杀的迈克尔等人深入沙漠，奥玛伤重不治，失去领路人，又被雷扎孤身追踪。雷扎凭借充足的汽油和武器，紧追不舍，迈克尔决定让其他人开越野车继续前行，自己驾驶丰田汽车车引开雷扎。迈克尔借沙丘转弯处跳车，用石头压住油门，自己藏身于备用轮胎后，雷扎上当追击，迈克尔趁机试图开走雷扎的车，却因车轮陷进沙坑失败。二人展开搏斗，迈克尔用螺丝刀捅瞎雷扎的眼睛，自己也被汽车碎片划伤，防冻液污染伤口。迈克尔开着雷扎的车在沙漠中寻找亚伯拉罕·林肯等人，因水箱破裂，引擎熄火后只能徒步前进。天色渐黑，林肯为寻找弟弟，在车顶燃放烟火并大喊其名字，远处出现迈克尔跌跌撞撞的身影，然而迈克尔伤势严重，有毒液体进入体内，唯一的医生远在也门，林肯陷入两难。
第7集
雅各布正准备庆祝回归正常生活，莎拉接到林肯的电话，得知迈克尔出事。费阿刻斯的人准备了走私船，可经红海前往克里特岛，迈克尔因公开身份是通缉恐怖分子无法就医，只能向曾是狱医的莎拉求救。莎拉清楚迈克尔是稀有的RH阴性血，危急时刻唯有自己的O型RH阴性血能救治，雅各布虽不满妻子前往希腊，却也无法阻止。莎拉深夜抵达克里特岛，在房间里见到亚伯拉罕·林肯、维普和虚弱的迈克尔，迈克尔无力回应，莎拉立即为其输注配好解毒剂的盐水袋，并为其输血。经过一夜救治，迈克尔恢复血色，清醒后想看儿子麦克的照片，看到雅各布的照片时愣住，告知莎拉雅各布就是波塞冬。迈克尔解释，被迫服从波塞冬后，曾与波塞冬在林间小屋碰头，中情局副局长哈伦·盖恩斯也在场，哈伦当时正在调查21真空组织，迈克尔才知晓自己的行动未获中情局批准。雅各布从背后枪杀哈伦，让迈克尔处理尸体并掩盖痕迹，事后修改照片栽赃迈克尔，迈克尔从那时起便策划回到莎拉身边。莎拉得知儿子仍在雅各布身边，心急如焚。亚伯拉罕·林肯已想好返回美国的办法，联系了在自由货船上工作的苏克雷，对方同意帮忙，但需支付五万美元船资，莎拉取下祖母留下的戒指作为船资。迈克尔叮嘱莎拉回国后伪装自己，切勿让雅各布察觉身份已暴露，随后目送莎拉前往机场。莎拉刚离开克里特岛，雅各布便收到消息，此前艾米丽和搭档因在国安局意图刺杀卡尼尔·乌提斯被岸田探员质询，二人灭口岸田后，接到雅各布的命令，严密监视从克里特岛出发的飞机和船只。莎拉经过十几个小时的飞行回到家，假装抱怨迈克尔，趁机寻找儿子，得知麦克在朋友帕特里克家后，偷偷联系好友海瑟接走麦克。确认麦克安全后，莎拉从墙洞取出手枪。与此同时，迈克尔在苏克雷的帮助下登上货船，船主看到海警的协查通报后反悔，向五角大楼通报情况，美国海军战斗舰随即驶向目标，并出动海豹突击队。迈克尔等人被反锁在船舱时，海军直升机已抵达并接管货船，海豹突击队发起进攻，却只找到被绑的苏克雷和大开的舷窗。苏克雷被带走后，迈克尔、亚伯拉罕·林肯和维普从床铺下的隔舱钻出，与海豹突击队周旋，苏克雷趁机打倒船长，转变航向驶向阿尔及利亚海域，毁坏导航和控制装置后躲藏起来。货船进入阿尔及利亚领海，海豹突击队因担心引发国际争端被迫撤离。雅各布懊恼之余，说服中情局高层授权发射导弹剿灭货船，放下电话后便看到莎拉举枪对准自己。莎拉低估了雅各布，雅各布早已注意到她的戒指不见，怀疑其已知晓真相，已派人前往海瑟家抢夺麦克，莎拉得知儿子仍在对方手中，被迫放下枪。迈克尔从海豹突击队撤离猜到海军的下一步行动，在导弹击中货船前，与众人跳入大海。
第8集
海面上漂浮着大量油迹，迈克尔等人坐在救生筏上，被一艘渔船营救。迈克尔回想起与波塞冬接触的细节，波塞冬的办公室在学院内，有严密的人脸识别门禁系统，自己曾随其进入一次，并推荐了维普。渔船抵达马赛，迈克尔收到莎拉的短信，察觉短信中对麦克的昵称并非莎拉的习惯，意识到莎拉和麦克身处危险，遂不动声色地回复。雅各布看到短信后，知晓导弹计划失败，开始准备应急方案。波塞冬的办公室内，艾米丽和搭档梵对迈克尔冒险返回美国的行为感到不解，雅各布无暇顾及二人想法，找来梭罗破解迈克尔纹身中的阿拉伯语加密信息。迈克尔也正根据纹身实施计划，茶包哥和布鲁斯分别收到指示，维普被派往芝加哥，苏克雷虽能找到另一艘货船，但两周的行程过长，亚伯拉罕·林肯提出一个冒险的办法，联系曾因自己丢毁走私药品而结怨的卢卡，以偿还十万美元为诱饵，换取走私飞机上的座位。雅各布通过手机定位查到迈克尔出现在里昂国际机场，分析出其抵达纽约的时间，派艾米丽和梵前往纽约机场灭口，二人循着手机信号找到的只是遗落在航班上的手机，苏克雷趁机从旁溜走。未找到迈克尔，雅各布命令二人返回协助转移莎拉和麦克，梵对雅各布的行为已心生不满，决定事后退出21真空组织。迈克尔设下迷魂阵躲过追踪，与亚伯拉罕·林肯乘坐卢卡的私人飞机抵达纽约州北部小机场的仓库。为支付十万美元，布鲁斯按迈克尔的指示乔装成缉毒组人员，迈克尔示意后，布鲁斯打电话叫来几辆黑色SUV，做贼心虚的卢卡误以为是缉毒组突袭，带着手下从后门逃走。希巴和几位朋友从SUV上下来，与众人叙旧后，迈克尔遣走布鲁斯，留下希巴协助对付波塞冬。维普按迈克尔给出的地理坐标来到密歇根湖中央，从浮标下找到一瓶鲜血，返回岸上时遇到茶包哥。原来迈克尔发现维普的生存本能与茶包哥相似，调查确认后安排二人见面，茶包哥得知维普是自己的儿子，深感雅威的宽恕。深夜，迈克尔、亚伯拉罕·林肯和希巴来到莎拉家外，潜入屋内无果后，迈克尔假装联系莎拉约定见面时间地点，预判出现的会是雅各布的人。次日，迈克尔未赴约，躲在暗处的雅各布遥控梵伪装成未找到迈克尔的样子，林肯出现后跟随梵，雅各布立即通知艾米丽跟踪，林肯突然消失在无信号的地下车库，艾米丽失策跑到雅各布藏身的车辆旁汇报，雅各布察觉中计迅速离开，蹲在楼顶的迈克尔将车型和车号通知希巴。希巴一路跟踪，找到雅各布遗弃的车辆，发现后备箱的血迹和抓痕，在后座缝隙里找到一张蜡笔画，画上八爪鱼袭击海盗船。迈克尔认为麦克继承了自己的基因，在图画中隐藏信息，对比地图后发现八爪鱼形状与手指湖区一致，X标志指向长湖东岸的一座小屋。为保障希巴的安全，迈克尔和亚伯拉罕·林肯前往长湖，远远看到雅各布驾车离开后，慢慢靠近小屋，从窗外看到麦克，心情激动之际未察觉远处公路上驶来的车辆。卢卡派人四处寻找林肯，此时举枪朝守在车上的林肯连开数枪，林肯倒在驾驶座上。迈克尔未发现林肯的异常，只顾着望向儿子，看到麦克走向里屋，屋内沙发上躺倒的女人让麦克露出惊恐表情，迈克尔误以为莎拉遇险，立即进屋。麦克看到迈克尔时毫无紧张，却表示从未画过海盗画，迈克尔大惊失色，发现沙发上的人并非莎拉，而是戴着假发的艾米丽，艾米丽随即举枪对准迈克尔。
第9集
雅各布安排艾米丽戴假发在沙发上守株待兔，被关在另一个房间的莎拉看清雅各布是思想偏激的疯子。雅各布承认为占有莎拉，将迈克尔派往也门送死，名义上是解救阿布·拉马尔。莎拉坚信迈克尔会打败雅各布，同时也未坐以待毙，将雅各布杀害哈伦副局长并栽赃迈克尔的事情说出，在场的梵听到后大惊，雅各布恼羞成怒用胶带封住莎拉的嘴，更让梵起了疑心。随后雅各布假装离开，引迈克尔潜入，艾米丽举枪对准迈克尔，梵突然挡在前面，要求问清哈伦死亡的真相并将迈克尔交给联调局，艾米丽执迷不悟射杀梵，迈克尔趁机抱起麦克逃进车库，让麦克去找亚伯拉罕·林肯，自己则堵住门。艾米丽正欲冲进车库，被挣脱束缚的莎拉从背后打晕。迈克尔和莎拉从车库跑出，远远看到麦克被折返的雅各布接上车，追之不及，跑到转弯处才发现林肯中弹倒在车里，所幸伤势虽重无性命之忧。二人将林肯送到医院，在警方赶来前匆忙离开。雅各布将麦克带到大学办公室，梭罗正在抓紧破解迈克尔纹身的秘密，雅各布欺骗麦克，谎称莎拉已被通缉恐怖分子卡尼尔·乌提斯杀害，麦克看到通缉令后信以为真，当迈克尔打电话要求交出麦克时，麦克对着电话大声让其滚开。迈克尔得知雅各布洗脑麦克，决定反击，安排莎拉前往医院确保亚伯拉罕·林肯平安，让茶包哥和维普带着从密歇根湖取回的鲜血寻找秘密武器，自己则前往雅各布的老巢。雅各布通过手机定位查到迈克尔在郊外，不远处是莎拉常带麦克去的北纽约州动物园，便与艾米丽赶去搜索，梭罗此时打来电话，告知迈克尔手掌上的眼睛纹身是拿破仑·波拿巴的名言永远不要在敌人犯错时打断他们，雅各布才意识到中了调虎离山之计。此时迈克尔已站在雅各布的办公室门外，手背上纹的雅各布脸型成功骗过面部识别系统，进入办公室后拿到服务器硬盘，掌握了21真空组织的全部秘密。因麦克在雅各布手中，二人约定次日下午五时在船坞见面。莎拉在医院未见到亚伯拉罕·林肯，得知林肯执意出院前往卢卡的仓库，还叫来真正的缉毒组报了仇。莎拉虽未找到林肯，却在医院发现了受伤的梵，梵无法说话，挣扎着写下麦克的安置地点。茶包哥和维普按指示在汽车旅馆找到迈克尔所说的王牌蓝色夏威夷人，此人擅长重建场景，是迈克尔此前从监狱中救出的。众人在老地方碰头，林肯也赶来汇合，最终决战的时刻来临。次日，迈克尔与雅各布在船坞见面，雅各布拒绝交出麦克，迈克尔掏枪后，艾米丽出现迫使迈克尔缴械，维普意外出现却被艾米丽射伤缴械，躲在暗处的茶包哥见儿子受伤冲了出来。远处传来警笛声，雅各布事先通知联调局前来抓捕恐怖分子卡尼尔·乌提斯，维普情绪激动上前抢夺枪支，被艾米丽开枪击中倒地。为避免更多人受伤，迈克尔答应交出硬盘，雅各布押着迈克尔去取硬盘时，联调局应急小队冲进船坞，茶包哥为子报仇，用机械手扭断艾米丽的脖子。雅各布押着迈克尔走向船坞深处，迈克尔的手机响起，莎拉和亚伯拉罕·林肯已根据梵提供的地点救出麦克并抓住亨利·梭罗。雅各布自知大势已去，欲杀迈克尔灭口，迈克尔趁其分神逃进一个小门，雅各布追进去开枪射击，却发现小门后是仿林间小屋的背景，自己枪杀哈伦的情景被再现。这是迈克尔计划的一部分，他进入办公室时不仅取走硬盘，还将哈伦的鲜血抹在办公室内，结合硬盘证据和梭罗的口供，中情局成功破获21真空组织，恢复了迈克尔的真实身份和自由。迈克尔、莎拉、林肯和希巴享受自由的阳光，雅各布被关进福克斯河监狱，当他看到睡在上铺的茶包哥时，脸上的笑容凝固了。
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